Metody badań strukturalnych w biotechnologii

Slides:



Advertisements
Podobne prezentacje
Kataliza heterogeniczna
Advertisements

izolowane pojedyncze cząsteczki w magnesy
WYKŁAD 8 Rozpuszczalność ciał stałych w cieczach
Atom wieloelektronowy
Efektywna szybkość zaniku magnetyzacji poprzecznej wiąże się z szerokością linii zależnością: w = 1/( T 2 *) = (1/ )R 2 * T 2 * - efektywny T 2, doświadczalny.
SPEKTROSKOPIA NMR PODEJŚCIE PRAKTYCZNE
SPEKTROSKOPIA NMR PODEJŚCIE PRAKTYCZNE
CHEMIA ORGANICZNA WYKŁAD 8.
Przesunięcie chemiczne
Wykład 6 Sprzężenie spin-spin.
Fizyka Ciała Stałego Ciała stałe można podzielić na:
Jak widzę cząstki elementarne i budowę atomu.
Metody badań strukturalnych w biotechnologii
Metody badań strukturalnych w biotechnologii
Metody badań strukturalnych w biotechnologii
Spektroskopowe metody identyfikacji związków
Metody NMR stosowane w badaniach biopolimerów
KWASY Kwas chlorowodorowy , kwas siarkowodorowy , kwas siarkowy ( IV ), kwas siarkowy ( VI ), kwas azotowy ( V ), kwas fosforowy ( V ), kwas węglowy.
FIZYKOCHEMICZNE WŁAŚCIWOŚCI GLEB
ALKANY- węglowodory nasyCONE.
DIELEKTRYKI TADEUSZ HILCZER
Jadwiga Konarska Widma wibracyjnego dichroizmu kołowego i ramanowskiej aktywności optycznej sec-butanolu: Pomiary eksperymentalne i obliczenia.
Podstawowe treści I części wykładu:
DYSOCJACJA JONOWA KWASÓW I ZASAD
Wiązania chemiczne -kowalencyjne* -jonowe -metaliczne teoria elektronowa teoria elektrostatyczna (pola kr.) teoria kwantowa -wiązania międzycząsteczkowe.
Wprowadzenie-węglowodory aromatyczne
MATERIA SKONDENSOWANA
Stereochemia W naszym życiu codziennym spotykamy wiele przedmiotów, których lustrzane odbicie nie daje się nałożyć na ten przedmiot. Przykładem może być.
Związki aromatyczne.
Metody badań strukturalnych w biotechnologii
Reakcje utlenienia i redukcji
IZOMERIA ZWIĄZKÓW ORGANICZNYCH Kliknij aby przejść dalej.
 [nm] 800 Podczerwień.
ZWIĄZKI OPTYCZNIE CZYNNE
WYKŁAD 2 Podstawy spektroskopii wibracyjnej, model oscylatora harmonicznego i anharmonicznego. Częstość oscylacji a struktura molekuły Prof. dr hab. Halina.
KWASY NIEORGANICZNE POZIOM PONADPODSTAWOWY Opracowanie
CHEMIA ORGANICZNA WYKŁAD 4.
Wędrówka jonów w roztworach wodnych
Politechnika Rzeszowska
Rodzaje wiązań chemicznych
Treści multimedialne - kodowanie, przetwarzanie, prezentacja Odtwarzanie treści multimedialnych Andrzej Majkowski 1 informatyka +
CHEMIA ORGANICZNA WYKŁAD 5.
Materiały pochodzą z Platformy Edukacyjnej Portalu
Fenole.
KRYSZTAŁY – RODZAJE WIĄZAŃ KRYSTALICZNYCH
Budowa cząsteczki o właściwości związku – wiązania międzycząsteczkowe
Amidy kwasów karboksylowych i mocznik
Typy reakcji w chemii organicznej
Izomeria związków organicznych
Cykloalkany Budowa, Szereg homologiczny,
Dipol elektryczny Układ dwóch ładunków tej samej wielkości i o przeciwnych znakach umieszczonych w pewnej odległości od siebie. Linie sił pola pochodzącego.
Szybkość i rząd reakcji chemicznej
Czynniki decydujące o mocy kwasów Moc kwasów beztlenowych Moc kwasów tlenowych Zasady Amfotery.
Dysocjacja jonowa, moc elektrolitu -Kwasy, zasady i sole wg Arrheniusa, -Kwasy i zasady wg teorii protonowej Br ӧ nsteda i Lowry`ego -Kwasy i zasady wg.
Kwasy i zasady - Kwasy i zasady wg Arrheniusa
Pozostałe rodzaje wiązań
Materiał edukacyjny wytworzony w ramach projektu „Scholaris - portal wiedzy dla nauczycieli” współfinansowanego przez Unię Europejską w ramach Europejskiego.
Wiązania międzyatomowe
Wiązania chemiczne.
Wiązanie kowalencyjne spolaryzowane
Halogenki kwasowe – pochodne kwasów karboksylowych
Moment dipolowy moment dipolowy wiązania, moment dipolowy cząsteczki,
Wiązania w sieci przestrzennej kryształów
Wiązania chemiczne Wiązanie jonowe Wiązanie kowalencyjne
Podstawy chemii organicznej – część I
Jednofunkcyjne pochodne węglowodorów i alkohole monohydroksylowe
Amidy kwasów karboksylowych i mocznik
Izomeria optyczna Związki optycznie czynne Stereoizomery enancjomery,
Mechanizm reakcji addycji elektrofilowej
Podstawowe typy reakcji organicznych Kwasy i zasady Lewisa
Zapis prezentacji:

Metody badań strukturalnych w biotechnologii Wykład IV Spektroskopia NMR – przesunięcie chemiczne

Wyznaczenie liczby równocennych i nierównocennych jąder dostarcza ważnych informacji strukturalnych i jest kluczowe w analizie widm 1H NMR. Na podstawie kryteriów symetrii lub podstawienia wyróżniamy następujące grupy atomów: - homotopowe, - enancjotopowe, - diastereotopowe

Protony homotopowe – kryterium symetrii: Protony, które w wyniku operacji symetrii (Cn) ulegają zamianie miejscami, tworząc cząsteczkę nieodróżnialną od wyjściowej.

Protony homotopowe – kryterium podstawienia: Protony, które można zastąpić (podstawić) kolejno dowolnym podstawnikiem achiralnym, uzyskując taki sam izomer.

Protony homotopowe Zastąpienie protonu na węglach C-1 i C-3 daje ten sam związek (1-chloropropan) Protony na węglach C-1 i C-3 są chemicznie równoważne i mają to samo przesunięcie ClCH2CH2CH3 CH3CH2CH2Cl H3CCH2CH3 7

Protony homotopowe CH3CH2CH2Cl

Protony enancjotopowe – kryterium symetrii: Protony, które są przemienne wobec inwersyjnej osi symetrii Sn.

Protony enancjotopowe – kryterium podstawienia: Protony, które zastąpione kolejno dowolnym podstawnikiem achiralnym X dają enancjomery.

Protony enancjotopowe CH2OH H3C H C CH2OH H3C Cl H C CH2OH H3C H Cl R S 11

Protony enancjotopowe

Protony diastereotopowe – kryterium symetrii: Protony, które są nieprzemienne wobec dowolnej operacji symetrii.

Protony diastereotopowe – kryterium podstawienia: Protony, które zastąpione kolejno dowolnym podstawnikiem achiralnym X dają diastereoizomery.

Protony diastereotopowe Zastąpienie protonu dowolną, inną resztą daje diastereomer Protony diastereotopowe mają różne przesunięcia chemiczne C Br H3C H d 5.3 ppm d 5.5 ppm 9

Protony diastereotopowe C Br H3C H d 5.3 ppm d 5.5 ppm 9

Chiralność rozpuszczalnika Przesunięcia chemiczne porównywanych protonów w rozpuszczalnikach:

OPIS UKŁADÓW SPINOWYCH Grupa jąder równocennych chemicznie i magnetycznie duża litera alfabetu Liczba jąder w grupie indeks cyfrowy u dołu tej litery Grupa jąder równocennych chemicznie, lecz nierównocennych magnetycznie te same litery alfabetu różniące się apostrofem

OPIS UKŁADÓW SPINOWYCH przykłady A3B A3KMX ABC ABCD A3B2

Liczba grup sygnałów pojawiających się na widmie 1H NMR zależy zatem od: - symetrii związku, - procesów dynamicznych zachodzących w cząsteczce, - obecności w sąsiedztwie heteroatomów, - chiralności używanego rozpuszczalnika, - bardzo zbliżonych lub przypadkowo takich samych przesunięć chemicznych nierównocennych protonów lub grup protonów

Czynniki wpływające na przesunięcie chemiczne: Gęstość elektronowa, Obecność wiązania wodorowego, Temperatura, Stężenie roztworu, Rodzaj rozpuszczalnika Obecność substancji paramagnetycznych

Gęstość elektronowa wokół protonu: Zmiana gęstości elektronowej powoduje wytworzenie indukowanego pola o innym natężeniu Zmniejszenie gęstości elektronowej – pole o mniejszym natężeniu – wartość δ rośnie – efekt odsłaniania Zwiększenie gęstości elektronowej – pole większym natężeniu – wartość δ maleje – efekt przesłaniania

Typowa lokalizacja przesunięć chemicznych na widmie 1H-NMR Niskie pole Wysokie pole (X = O, Hal) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 TMS

Elektroujemność wg Paulinga Wpływ elektroujemności podstawnika w CH3X na przesunięcie chemiczne grupy metylowej X Elektroujemność wg Paulinga Δ-CH3, ppm F O – Cl Br I S – H LI 4.0 3.5 (CH3)2O 3.0 2.8 2.5 2.5 (CH3)2S 2.1 1.0 4.26 3.24 3.05 2.68 2.16 2.08 0.23 -1.30

Gęstość elektronowa wokół protonu:

Wpływ występowania momentu dipolowego na wartość przesunięcia chemicznego: δ: 5.06; 13.5 1.33; -0.99 Obecność ładunku zdelokalizowanego jest przyczyną odsłaniania protonów (kation izopropylowy) lub przesłaniania protonów (etylolit).

Niewiązaniowe oddziaływanie elektronów – efekt Van der Waalsa Proton δ [ppm] H1 7.71 H2 8.12 H3 7.82 H4 7.88 H5,H6 8.93

Obecność wiązania wodorowego: δ: 10.60 ppm δ: 5.04 ppm Wiązania wodorowe powodują przesunięcie sygnałów protonów biorących w nich udział w kierunku pól o mniejszym natężeniu

Obecność wiązania wodorowego

Wpływ temperatury Temperatura wpływa na zmianę przesunieć chemicznych protonów związanych z heteroatomami – ma to związek z tworzeniem lub zrywaniem wiązań wodorowych

Stężenie roztworu Stężenie roztworu ma wpływ na przesunięcie chemiczne w przypadku grup wykazujących zdolność tworzenia wiązań wodorowych, np sygnał grupy –OH w fenolu w rozcieńczonych roztworach w CCl4 obserwuje się przy 4.25 ppm a w roztworach stężonych przy 6.75 ppm.

Rodzaj rozpuszczalnika Polarność rozpuszczalnika Anizotropia rozpuszczalnika – tworzenie kompleksów typu charge-transfer np. grupy metylowe N,N-dimetyloacetamidu z benzenem

Obecność substancji paramagnetycznych Tworzenie kompleksów metali przejściowych zmienia otoczenie chemiczne protonów i różnicuje ich przesunięcia chemiczne. Fakt ten jest wykorzystywany jako odczynniki przesunięcia chemicznego (shifts reagents) najczęściej stosowane są kompleksy Eu3+ i Pr3+