„Spektroskopia Ramana aminokwasów” SEMINARIUM W RAMACH PROJEKTU „Kwantowe nanostruktury półprzewodnikowe do zastosowań w biologii i medycynie - Rozwój i komercjalizacja nowej generacji urządzeń diagnostyki molekularnej opartych o nowe polskie przyrządy półprzewodnikowe. ” Sylwester Gawinkowski, Ryszard Koliński, Agnieszka Michota-Kamińska, Jacek Waluk „Spektroskopia Ramana aminokwasów” Instytut Chemii Fizycznej PAN 24 czerwca 2009 r. (środa), godz. 10:00 Aula IChF PAN, W-wa, ul. Kasprzaka 44/52 1
Budowa i właściwości aminokwasów Instytut Chemii Fizycznej PAN 2
Spektroskopia Ramana aminokwasów Instytut Chemii Fizycznej PAN Jak daleko jesteśmy? 785 633 514 325 100% kryształ roztwór (H2O) symulacja (DFT) 3
Atlas (katalog) widm Ramana cysteina 325 nm 514 nm 633 nm 785 nm prolina 325 nm 514 nm 633 nm 785 nm Instytut Chemii Fizycznej PAN 4
Zastosowania analityczne Instytut Chemii Fizycznej PAN 5
Porównanie widm z roztworu i ciała stałego z symulacją Porownanie widm Ramana alaniny w krysztale (niebieskie) i w roztworze wodnym (czerwone). Porownanie widma eksperymentalnego Ramana fenyloalaniny w krysztale (niebieskie) i symulacji DFT (czerwone). Porownanie widm Ramana cysteiny w krysztale (czarne) i w roztworze wodnym (czerwone). Instytut Chemii Fizycznej PAN 6
Czy jesteśmy w stanie odczytać strukture I-szo rzędową? aminokwasy –> peptydy –> białka Drgania charakterystyczne grup Instytut Chemii Fizycznej PAN 7
W roztworze krysztale arg-gly-asp arg-gly-asp-ser 8 Instytut Chemii Fizycznej PAN 8
W krysztale cys cys-cys-cys gly gly-gly-gly 9 Instytut Chemii Fizycznej PAN 9
W roztworze H2O Co dalej? - SERS ! - analiza białek ? - ... gly gly-gly-gly Co dalej? - SERS ! - analiza białek ? - ... Instytut Chemii Fizycznej PAN 10
Podziękowania dr inż. Ryszard Koliński dr Agnieszka Michota-Kamińska prof. dr hab. Jacek Waluk prof. dr hab. Robert Hołyst Instytut Chemii Fizycznej PAN 11