Pobieranie prezentacji. Proszę czekać

Pobieranie prezentacji. Proszę czekać

Czy komputery zabiją genomikę?. Problemy Ogromne ilości danych do przechowywania Zbyt słabe komputery aby „łączyć” sekwencje Nieoptymalne formaty danych.

Podobne prezentacje


Prezentacja na temat: "Czy komputery zabiją genomikę?. Problemy Ogromne ilości danych do przechowywania Zbyt słabe komputery aby „łączyć” sekwencje Nieoptymalne formaty danych."— Zapis prezentacji:

1 Czy komputery zabiją genomikę?

2 Problemy Ogromne ilości danych do przechowywania Zbyt słabe komputery aby „łączyć” sekwencje Nieoptymalne formaty danych

3 Genom Genom to łańcuch zasad Zasady mogą występować w jednej z kilkudziesięciu odmian Genom może się składać z 4000 do zasad Genom człowieka składa się z 2 kopii, a każda ma zasad

4 Łączenie sekwencji Dzisiejsze maszyny generują krótkie sekwencje (50 – 120 zasad), które trzeba połączyć w całość Wynikiem działania najczęściej jest obraz, zamiast bardziej przyjaznych formatów

5 Przechowywanie danych Współczesne urządzenia są w stanie wyprodukować 5TB dziennie Baza danych zawierająca pełne genomy 629 ludzi ma 7.3TB danych Oprócz samego wyniku trzeba zapisać jak dokładna była analiza Możliwości sekwencjonowania podwajają się co 5 miesięcy

6 Przechowywanie danych cd.

7 Możliwe rozwiązania Cloud computing Lepsze formaty danych Zamiast zapamiętywać dane, za każdym razem od nowa sekwencjonować

8 Formaty danych Zapamiętywać zasady wraz z ich jakością Zapamiętać jeden wzorzec, i różnice pomiędzy nim a nowym genomem Takie różnice występują statystycznie na 0.1% pozycji Tracimy wtedy informacje o jakości

9 Cloud computing - zalety Możliwość taniego składowania danych Dostęp do dużej mocy obliczeniowej Nie trzeba za każdym razem ściągać danych, tylko wykonywać obliczenia w chmurze Trudniej zniszczyć dane w chmurze

10 Cloud computing - wady Bezpieczeństwo danych Upload/download danych może trwać wiele tygodni Wymiana informacji między chmurami Mało programów, które wspierają prace w chmurze Obecnie ceny nie uzasadniają przejścia do chmury Brak standardów przechowywania danych, protokołów itp.


Pobierz ppt "Czy komputery zabiją genomikę?. Problemy Ogromne ilości danych do przechowywania Zbyt słabe komputery aby „łączyć” sekwencje Nieoptymalne formaty danych."

Podobne prezentacje


Reklamy Google