Czy komputery zabiją genomikę?. Problemy Ogromne ilości danych do przechowywania Zbyt słabe komputery aby „łączyć” sekwencje Nieoptymalne formaty danych.

Slides:



Advertisements
Podobne prezentacje
Indeksy w bazie danych Oracle
Advertisements

Telefonia w chmurze Błażej Pawlik Błażej Pawlik.
Sieci komputerowe.
Telefonia IP Autor: Artur Nowak. Nim zaczniemy... Ilu osób spośród Państwa spotkało się z określeniem telefonia IP, VoIP itp. ?
Użytkowanie Sieci Marcin KORZEB WSTI - Użytkowanie Sieci.
przetwarzaniu informacji
ARCHIWIZACJA I KOMPRESJA DANYCH
zarządzanie produkcją
Narzędzia CASE pod Linux
Zapis danych.
KOMPUTER JAKO ŚRODEK TECHNIKI BIUROWEJ
ELEMENTY SKŁADOWE JEDNOSTKI CENTRALNEJ
Proxy (WWW cache) Sieci Komputerowe
Mateusz Mikołajczyk to serwer lub program (np. Squid dla Unixa) jest pośrednikiem między siecią a klientem udostępnia klientom zasoby Internetowe.
Zadanie 1.
Artur Szmigiel Paweł Zarębski Kl. III i
Rozproszone bazy danych
Opracował: mgr Mariusz Bruździński
Multimedialne bazy danych
? Rosnące potrzeby użytkowników Rozmiar problemu Czas Komputer domowy
Temat 3: Co to znaczy, że komputer ma pamięć? Czy można ją zmierzyć?
Drukarka Urządzenie wyjścia.
Kod Graya.
Budowa Komputera Co powinieneś znać !.
… iSCSI … Windows Server 2012 Łukasz Dylewski.
Bazy danych z zakresu genomiki, biotechnologii i jakości produktów pochodzenia zwierzęcego Jolanta Oprządek, Grażyna Sender, Magdalena Sobczyńska, Łukasz.
Podstawowe pojęcia i problemy związane z przetwarzaniem plików graficznych.
System generowania wzorów matematycznych MathML
Maciej Kujawiński i Daniel Krystyniak, klasa 2G
Autor: Justyna Radomska
Solphy Polska Prezentacja Produktu Solphy Home Storage.
Temat 4: Rodzaje, budowa i funkcje urządzeń sieciowych.
a przekonamy się w jak wielu miejscach są wykorzystywane
Dynamiczna rekonfiguracja układów FPGA
Budowa i rodzaje procesorów.
Rok z Kodeksem 2.0 – plusy i minusy
Buforowanie D e f i n i c j a.
Budowa komputera.
Autorzy:Ania Szczubełek Kasia Sul
Wybrane zagadnienia relacyjnych baz danych
Macierze dyskowe Tymoteusz Szukała.
Grafika komputerowa Jest to dziedzina rozwijająca się niezwykle dynamicznie, a jednocześnie wymagająca znacznej mocy obliczeniowej. Łatwo możemy to zaobserwować,
Prezentują: Marek Wałach UX Designer Marcin Ceran PHP Developer.
Podstawy bioinformatyki – sekwencjonowanie nowej generacji
KARTY DŹWIĘKOWE.
 Karta sieciowa to urządzenie odpowiedzialne za wysyłanie i odbieranie danych w sieciach LAN. Każdy komputer, który ma korzystać z dobrodziejstw sieci,
Toruń 28/ Metadane SAML opisują, w jaki sposób ma być realizowana komunikacja pomiędzy IdP i SP Metadane są typowo prezentowane w postaci XML.
System Zarządzania Bazą Danych
Komputer w naszym życiu
Jak powstaje chmura? Maciej Nabożny, Miłosz Zdybał
Algorytmy Genetyczne Anna Tomkowska Politechnika Koszalińska
Adaptacyjne Systemy Inteligentne Maciej Bielski, s4049.
1.Rozpoczęcie działalności w 1983 r., 2.Udział w przetargach i realizacja wszystkich zadań z zakresu budownictwa drogowego, 3.Obszar działań obejmuje.
KOMPUTER JAKO ŚRODEK TECHNIKI BIUROWEJ
Jednostka centralna.
Model warstwowy ISO-OSI
Bezpieczeństwo cloud computing FAKTY I MITY Beata Marek, cyberlaw.pl Beata Marek, cyberlaw.pl Kancelaria w chmurze, Kancelaria w chmurze, 19.X X.2012.
InformatykaZakresrozszerzony Zebrał i opracował : Maciej Belcarz Obraz i edycja filmów.
Druk cyfrowy Kamila Perdon 3c.
Logistyka – Ćwiczenia nr 6
Adam Radzicki I iam Michał Moszkowski I iam Kacper Kujawa I iam.
Konferencja Sadownicza Jabłkowe problemy – sposoby rozwiązania Jak producenci mogą poprawić zorganizowanie naszego rynku jabłek Witold Boguta Krajowy Związek.
TOPOLOGIE SIECI. Topologia sieci- określa sposób połączenia urządzeń sieciowych ze sobą. Najbardziej znane topologie:  Topologia magistrali  Topologia.
Wady i zalety pracy w chmurze
materiały dla uczestników
The CC1 system Prywatna chmura The CC1 system
Miłosz Zdybał System CC1 - prywatna chmura obliczeniowa w IFJ PAN.
Macierzowe systemy kodowania konstytucji cząsteczki
Twardy dysk - pamięć masowa
Statystyki serwera www Serwer proxy Cash .....
Zapis prezentacji:

Czy komputery zabiją genomikę?

Problemy Ogromne ilości danych do przechowywania Zbyt słabe komputery aby „łączyć” sekwencje Nieoptymalne formaty danych

Genom Genom to łańcuch zasad Zasady mogą występować w jednej z kilkudziesięciu odmian Genom może się składać z 4000 do zasad Genom człowieka składa się z 2 kopii, a każda ma zasad

Łączenie sekwencji Dzisiejsze maszyny generują krótkie sekwencje (50 – 120 zasad), które trzeba połączyć w całość Wynikiem działania najczęściej jest obraz, zamiast bardziej przyjaznych formatów

Przechowywanie danych Współczesne urządzenia są w stanie wyprodukować 5TB dziennie Baza danych zawierająca pełne genomy 629 ludzi ma 7.3TB danych Oprócz samego wyniku trzeba zapisać jak dokładna była analiza Możliwości sekwencjonowania podwajają się co 5 miesięcy

Przechowywanie danych cd.

Możliwe rozwiązania Cloud computing Lepsze formaty danych Zamiast zapamiętywać dane, za każdym razem od nowa sekwencjonować

Formaty danych Zapamiętywać zasady wraz z ich jakością Zapamiętać jeden wzorzec, i różnice pomiędzy nim a nowym genomem Takie różnice występują statystycznie na 0.1% pozycji Tracimy wtedy informacje o jakości

Cloud computing - zalety Możliwość taniego składowania danych Dostęp do dużej mocy obliczeniowej Nie trzeba za każdym razem ściągać danych, tylko wykonywać obliczenia w chmurze Trudniej zniszczyć dane w chmurze

Cloud computing - wady Bezpieczeństwo danych Upload/download danych może trwać wiele tygodni Wymiana informacji między chmurami Mało programów, które wspierają prace w chmurze Obecnie ceny nie uzasadniają przejścia do chmury Brak standardów przechowywania danych, protokołów itp.