PODSUMOWANIE METOD KINETYCZNYCH Kuba Skrzeczkowski Zajęcia 50

PRZED NAMI… Przybliżenie stanu stacjonarnego (steady-state approximation) Metoda szybkości początkowych (initial rates method) Metoda pozornych stałych szybkości (apparent rate constants method).

MECHANIZM MICHAELISA - MENTEN

JAK DZIAŁA ENZYM? Lock and key model. Pobrane z: http://www.chemistry.wustl.edu/~edudev/LabTutorials/Carboxypeptidase/carboxypeptidase.html

KARBOKSYPEPTYDAZA To przykład enzymu: Widać tu miejsce aktywne enzymu: Zwróć uwagę na kształt enzymu… Źródło: http://www.chemistry.wustl.edu/~edudev/LabTutorials/Carboxypeptidase/carboxypeptidase.html

Gdyby jej nie było to nasz brzuch wyglądałby tak:

Ponieważ jest to wygląda to tak:  http://gminabraniewo.pl/cms/images/info/odpady_1.jpg

Ewentualnie jak ktoś je za dużo: http://bi.gazeta.pl/im/6/8259/z8259726Q,Pojemniki-na-rozne-typy-smieci.jpg

Więc … Karboksypeptydaza pełni rolę maszynki do przetwarzania aminokwasów! Rozwala peptydy, które wchodzą do organizmu na aminokwasy. Z tych aminokwasów budujemy peptydy, których potrzebujemy.

Ogólne działanie http://www.chemistry.wustl.edu/~edudev/LabTutorials/Carboxypeptidase/carboxypeptidase.html

Mechanizm Michaelisa - Menten Ćwiczenie. Wyprowadź równanie na szybkość tworzenia produktu w reakcji katalizowanej enzymem?

Wyprowadzone równanie… Powinno mieć postać: Ale w tym równaniu mamy [E], którego możemy nie znać. Tymczasem znamy [E]0 które znamy (bo przecież wiemy ile wprowadzaliśmy). Jak zmodyfikować równanie?

ROZWIĄZANIE Odpowiedź: Na etapie stosowania przybliżenia stanu stacjonarnego wprowadzamy: [E]0 = [E] + [ES] Robienie tego potem może skutkować brakiem możliwości usunięcia [ES].

STAŁA MICHAELISA Jak łatwo zauważyć z wyprowadzonego równania: Stała Michaelisa to takie stężenie substratu przy którym szybkość jest równa połowie szybkości maksymalnej.

STAŁA MICHAELISA Km świadczy o powinowactwie enzymu do substratu. Im mniejsze tym łatwiej osiągnąć vmax zatem powinowactwo większe, zatem substrat lepiej pasuje do dziury w enzymie.

„Ty to masz takie Km że w każdą dziurę wejdziesz!” ŻART BIOCHEMIKÓW „Ty to masz takie Km że w każdą dziurę wejdziesz!” http://media.oampss.tv-sport.pl/media/filer_public_thumbnails/filer_public/2013/04/03/chemicy.jpg__300x199_q85.jpg

INITIAL RATES METHOD

METODA SZYBKOŚCI POCZ. Korzystając z metody szybkości początkowych wyznacz rząd reakcji względem substratów oraz stałą szybkości.

OGÓLNA METODA… 𝑣=𝑘 [𝐴] 𝑎 [𝐵] 𝑏 log 𝑣 =𝑙𝑜𝑔𝑘+a ∗log A +b ∗log [B] Utrzymując stałe stężenie [B] podczas eksperymentu: log 𝑣 =𝑎 ∗ log 𝐴 +𝑐𝑜𝑛𝑠𝑡 Co jest funkcją liniową (log(v) = f(log[A])) Współczynnik kierunkowy = a Taką metodę stosuje się przy dużych ilościach danych.

CHCĄC ZROZUMIEĆ DUŻE ILOŚCI DANYCH… PRZYKŁAD Z ICHO 40th International Chemistry Olympiad

Chcąc obliczyć rząd dla [Br2]

Wykres

ZADANIE… Otrzymaliśmy w ten sposób rząd zero dla Br2. Zadanie: Wyznacz graficznie rząd dla Na2S2O6 oraz jonów wodorowych.

POZORNE STAŁE SZYBKOŚCI