Wykorzystano materiały Tomasz Strabel, UP Poznań Selekcja genomowa 2016 Krzysztof Gałązka Wykorzystano materiały Tomasz Strabel, UP Poznań

Wyniki kontroli użytkowości Informacja rodowodowa Informacja o markerach WH konwencjonalna WH genomowa

Selekcja buhajów i samic Metoda tradycyjna (dotychczasowa) wymagała 6 lat od kojarzenia pary rodzicielskiej do wyceny urodzonego buhaja na jego córkach! Dokładność oceny wh samic osiąga max. 45% Model tradycyjny jest dokładny ale kosztowny i trwający w czasie.

… POPRZEZ WYKORZYSTANIE MARKERÓW GENETYCZNYCH – SELEKCJA GENOMOWA ZACZETO STAWIAĆ PYTANIA, W JAKI SPOSÓB: 1- OBNIŻYĆ KOSZTY WYCENY? 2- WCZESNIEJ UZYSKAĆ WYNIKI OCENY WH? 3- PRZYSPIESZYĆ POSTĘP? … POPRZEZ WYKORZYSTANIE MARKERÓW GENETYCZNYCH – SELEKCJA GENOMOWA

Selekcja genomowa MARKER GENETYCZNY, CO TO JEST? Fragment DNA, który dziedziczy się w kolejnych pokoleniach. Marker pozwala przewidzieć genetyczną wartość cech użytkowych Wykorzystuje się techniki laboratoryjne oraz modele statystyczne do pozyskania wyników

Selekcja genomowa DNA znajduje się w chromosomach jąder komórkowych, zawiera informację genetyczną. Chromosomy zawierają 30 000 genów Liczba poznanych fragmentów DNA (markerów genetycznych) ma wpływ na dokładność oceny Dotychczas poznano 60 000 markerów Dziedzina poznawania kolejnych markerów jest bardzo rozwojowa

Selekcja genomowa Wyniki genomowania prezentowane są w postaci indeksu zgodnie z obowiązującą formułą Bezpośrednia genomowa wh jest niezależna od metody tradycyjnej Wiarygodność wyniku oceny jest wyższa dla cech wysoko odziedziczalnych (np. prod. mleka) oraz niższa dla nisko odziedziczalnych (np. płodność)

Wzbogacenie genomowe Wzbogacenie genomowe 50-100 córek >100 córek Ocena tradycyjna Ocena genomowa 50-100 córek >100 córek Indeks rodowodowy

Program selekcji buhajów na podstawie potomstwa Wybór rodziców, kojarzenie 6 Indeks buhaja Urodzenie buhajka 9 15 Testowanie 3 9 Urodzenia córek 1 Inseminacja 24 Wycielenia córek 6 lat

Selekcja buhajów Ostrość selekcji (tradycyjna) ograniczona była przez liczbę testowanych buhajów Dokładność zależna jest w istotny sposób od współczynnika odziedziczalności Koszt oceny buhaja to kilkadziesiąt tysięcy EURO

Selekcja genomowa buhajów Skrócenie odstępu między pokoleniami (decyzja przy pierwszym unasienianiu jałówki) Wzrost dokładności oceny i selekcji młodych samic (ale spadek dokładności oceny buhajów) Zwiększenie postępu genetycznego (2-krotnie) Obniżenie kosztów realizacji programów hodowlanych, związanych z wyczekiwaniem buhajów

Selekcja genomowa buhajów Obniżenie tempa przyrostu inbredu; nowe linie genetyczne (…?) Wzrost znaczenia samic w programach hodowlanych (wyższa dokładność). Bardzo wczesna informacja m.in. o długowieczności. Dla cech nisko odziedziczalnych wymagana jest odpowiednio liczebna baza referencyjna.

Selekcja genomowa Selekcja genomowa polega na selekcjonowaniu buhajów i samic na podstawie ich wartości hodowlanej, obliczonej bezpośrednio w oparciu o markery genetyczne rozmieszczone na całym genomie tak zwane SNP- (polimorfizmy jedno nukleotydowe)

Selekcja genomowa buhajów Wartość alleli markerów jest obliczana na podstawie populacji referencyjnej w oparciu o połączenie informacji genomowej z informacją fenotypową. Baza populacji referencyjnej - wyniki buhajów na podstawie potomstwa mających informację genomową.

Selekcja genomowa - równania predykcji PA Znany fenotyp √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ Znany genotyp Równania predykcji GWH GWH GWH GWH GWH GWH GWH

Selekcja genomowa buhajów – Populacja referencyjna Niski współczynnik spokrewnienia badanego osobnika z populacją referencyjną wpływa na obniżenie dokładności genomowej wh Stały wzrost liczebności bazy referencyjnej jest nieodzownym elementem ulepszania wyników genomowania

Selekcja genomowa buhajów- Roczny postęp genetyczny W wyniku: - większej intensywności selekcji matek buhajów, - wyższej dokładności indeksów matek buhajów, - skróceniu odstępu międzypokoleniowego… …postęp genetyczny zwiększy się dla wszystkich cech - dwukrotnie.

Selekcja genomowa buhajów - wzrost znaczenia samic W programach oceny i selekcji buhajów wzrasta ranga samic (MB), głównie z powodu wzrostu dokładności wartości hodowlanych . Drugim powodem jest wczesna informacja. Samice zostają odpowiednio kojarzone z buhajami już jako jałówki. Pojawia się szansa na wprowadzenie do hodowli nowych linii rodowodowych 

Genotypowanie a zarządzanie stadem   Poznanie wartości hodowlanych młodych samic pozwala na trafne decyzje selekcyjne w stadzie Znajomość ocen wh zarówno produkcyjnych, jak i funkcjonalnych na etapie jałówek zmniejszy koszty odchowu eliminując sztuki o zbyt niskich oczekiwanych parametrach. Już podczas pierwszego unasieniania, gdy znamy parametry hodowlane jałówki mamy realną możliwość precyzyjnego doboru buhaja o optymalnych wartościach hodowlanych.

Selekcja genomowa buhajów -znaczenie owub Ocena wartości użytkowej bydła nadal będzie niezbędna, gdyż selekcja genomowa wymaga weryfikacji o informacje fenotypowe.

Selekcja genomowa buhajów -Postęp hodowlany Rt – wielkość postępu hodowlanego w jednostce czasu i – ostrość selekcji p - dokładność oceny (selekcji) бA – zmienność genetyczna L – odstęp pokoleń

Selekcja genomowa buhajów POLSKA Program genotypowania od 2008 przez konsorcjum MASinBULL (SHiUZ Bydgoszcz, Uniwersytet Olsztyn i Wrocław IZ Balice) 2010 wyniki oceny genomowej kg białka uznał INTERBULL 2011 MCB Krasne przystępuje do konsorcjum 2012 SU Łowicz i Tulce włączają się do konsorcjum – zmiana „Genomika Polska”

Selekcja genomowa buhajów POLSKA X.2012 Genomika Polska przystępuje do EuroGenomics XII.2012 walidacja pokroju w Interbbull VII.2013 walidacja produkcji, komórek somatycznych i płodności – pozytywna walidacja w Interbull.

Selekcja genomowa buhajów POLSKA Ocena genomowa w Polsce uznana jest jako oficjalna i wdrożona od wyceny sierpniowej 2014.2 Dopuszczone jest nasienie buhajów genomicznych pochodzących z Europy i Ameryki

Selekcja genomowa POLSKA PFHBiPM realizuje ocenę genomową jałowic i krów, na potrzeby zarządzania stadem oraz na potrzeby programów hodowlanych. Analiza genomowa wykonywana jest w Laboratorium Genetyki Bydła w Parzniewie.

Selekcja genomowa buhajów POLSKA Krajowy program hodowlany dla rasy PHF został odpowiednio zaktualizowany w przez PFHBiPM. W dalszej konsekwencji Spółki Unasieniania w Polsce zmodyfikowały realizowane programy oceny i selekcji buhajów PHF

Selekcja genomowa buhajów POLSKA SEZON LICZBA HODOWCÓW LICZBA SAMIC WARTOŚCI gPF 2015.1 68 HO – 1238 95-148 RW - 106 88-127 2015.2 82 HO -1109 92-144 RW - 91 79-127 2015.3 116 HO – 1135 91-159 RW - 113 92-123