Spektroskopowe metody identyfikacji związków

Slides:



Advertisements
Podobne prezentacje
Laboratorium na pilota Noc naukowców, września 2007.
Advertisements

Cele wykładu - Przedstawienie podstawowej wiedzy o metodach obliczeniowych chemii teoretycznej - ich zakresie stosowalności oraz oczekiwanej dokładności.
izolowane pojedyncze cząsteczki w magnesy
Zakład Spektroskopii Mössbauerowskiej Akademia Pedagogiczna w Krakowie
MAGNETYCZNA RELAKSACJA JĄDROWA W FAZIE CIEKŁEJ
Efektywna szybkość zaniku magnetyzacji poprzecznej wiąże się z szerokością linii zależnością: w = 1/( T 2 *) = (1/ )R 2 * T 2 * - efektywny T 2, doświadczalny.
Efektywna szybkość zaniku magnetyzacji poprzecznej wiąże się z szerokością linii zależnością: w = 1/( T 2 *) = (1/ )R 2 * T 2 * - efektywny T 2, doświadczalny.
Metody NMR stosowane w badaniach biopolimerów
Metody NMR stosowane w badaniach biopolimerów
SPEKTROSKOPIA NMR PODEJŚCIE PRAKTYCZNE
SPEKTROSKOPIA NMR PODEJŚCIE PRAKTYCZNE
Cząsteczki homodwujądrowe
PROMIENIOWANIE X, A ENERGETYCZNA STRUKTURA ATOMÓW
pomiar NMR spektroskopia impulsowa
Wykład 6 Sprzężenie spin-spin.
OPTOELEKTRONIKA Temat:
Metody badań strukturalnych w biotechnologii
Czułość pomiarów NMR.
Metody badań strukturalnych w biotechnologii Wykład 1 Wprowadzenie w zagadnienia spektroskopii Spektroskopia w podczerwieni (IR)
Metody badań strukturalnych w biotechnologii
Metody badań strukturalnych w biotechnologii
Najważniejsze techniki dwuwymiarowej spektroskopii NMR TechnikaInformacja Korelacje poprzez homojądrowe J ij; współrzędne δ(H i ), δ(H j ) Cosy (Correlation.
Metody badań strukturalnych w biotechnologii
Metody NMR stosowane w badaniach biopolimerów
GENOMIKA FUNKCJONALNA U ROŚLIN
Magnetyczny rezonans jądrowy
ZAKŁAD RADIOSPEKTROSKOPII
WYKŁAD 7 a ATOM W POLU MAGNETYCZNYM cz. 2 (wewnętrzne pola magnetyczne w atomie; poprawki na wzajemne oddziaływanie momentów magnetycznych elektronu; oddziaływanie.
Metody określania struktury enzymów (część II)
Jadwiga Konarska Widma wibracyjnego dichroizmu kołowego i ramanowskiej aktywności optycznej sec-butanolu: Pomiary eksperymentalne i obliczenia.
Badanie transportu w biomatrycach lipidowych z zastosowaniem spektroskopii NMR Dorota Michalak Praca magisterska napisana pod okiem dr hab. Marcina Pałysa.
Pracownia Peptydów Wydziału Chemii UW Jarosław Stańczewski
Elektrochemiczne właściwości metalicznego renu
Zastosowanie programu SYBYL do wygładzania przybliżonych modeli białkowych SEKWENCJA AMINOKWASOWA MODELOWANIE METODĄ DYNAMIKI MONTE CARLO NA TRÓJWYMIAROWEJ.
Rys. 3. Widmo NOESY wraz z przypisaniem sekwencyjnym.
Metody oznaczania biopierwiastków
, Prawo Gaussa …i magnetycznego dla pola elektrycznego…
Podstawowe treści I części wykładu:
PRZYKŁADY Metody obrazowania obiektów
Oscylacje Rabiego – masery, rezonans magnetyczny, qubity 2
E = Eelektronowa + Ewibracyjna + Erotacyjna + Ejądrowa + Etranslacyjna
Obraz tworzenia się asocjatów pomiędzy konkanawaliną A i porfirynami w roztworach i w materiałach zol-żelowych Katarzyna Polska, Stanisław Radzki Wydział.
Mikołaj Siergiejew Zakład Fizyki Ciała Stałego, IF USz
Marcin Berłowski, Zakład Fizyki Wielkich Energii IPJ
SKANINGOWA MIKROSKOPIA Z ROZDZIELCZOŚCIĄ ATOMOWĄ
Metody badań strukturalnych w biotechnologii
Wykład z cyklu: Nagrody Nobla z Fizyki:
Metody obliczeniowe przewidywania interakcji białek z RNA
 [nm] 800 Podczerwień.
„BLASKI I CIENIE PROMIENIOTWÓRCZOŚCI”
WYKŁAD 2 Podstawy spektroskopii wibracyjnej, model oscylatora harmonicznego i anharmonicznego. Częstość oscylacji a struktura molekuły Prof. dr hab. Halina.
Fizyka jądrowa Kusch Marta I F.
Fluorescencja.
___________________________________________________________________________________________________________________________ 1. Wstęp1 Konferencja APES-IES-SEST.
Maria Goeppert-Mayer Model Powłokowy Jądra Atomowego.
Treści multimedialne - kodowanie, przetwarzanie, prezentacja Odtwarzanie treści multimedialnych Andrzej Majkowski informatyka +
H-wodór.
Laboratorium Laserowej Spektroskopii Molekularnej PŁ SERS dr inż. Beata Brożek-Pluska.
Dr hab. Przemysław Szczeciński, prof. nzw. PW
Analiza szeregów czasowych
Modele jądra atomowego Od modeli jądrowych oczekujemy w szczególności wyjaśnienia: a) stałej gęstości materii jądrowej, b) zależności /A od A, c) warunków.
FIZYKA W MEDYCYNIE FIZYKA INŻYNIERIA BIOLOGIA PACJENT PACJENT LEKARZ.
ZASTOSOWANIE SPEKTROSKOPII NMR W MEDYCYNIE
PRZYKŁADY Metody obrazowania obiektów
Zakaz Pauliego Kraków, Patrycja Szeremeta gr. 3 Wydział: Górnictwa i Geoinżynierii Kierunek: Zarządzanie i Inżynieria Produkcji.
Budowa atomu Poglądy na budowę atomu. Model Bohra. Postulaty Bohra
Wyznaczanie przesunięć chemicznych i stałych ekranowania w jonach NH 4 + za pomocą spektroskopii jądrowego rezonansu magnetycznego Piotr Krajewski V L.O.
PRZYKŁADY Metody obrazowania obiektów
E = Eelektronowa + Ewibracyjna + Erotacyjna + Ejądrowa + Etranslacyjna
Podstawy teorii spinu ½
Zapis prezentacji:

Spektroskopowe metody identyfikacji związków Spektroskopia NMR – techniki dwuwymiarowe Obrazowanie rezonansem magnetycznym (MRI)

Widmo kamfory wykonane przy różnej rozdzielczości spektrometru

Eksperymenty jednowymiarowej spektroskopii NMR – badanie wiązań wodorowych NHGly(1) / NHΔAla(5) / NHGly(4) / NHΔAla(2) \ - NHGly(3) / NHGly(6) Wpływ temperatury na wartość przesunięcia chemicznego protonów amidowych dla peptydu Boc–Gly-ΔAla-Gly–Gly-ΔAla-Gly-OMe

Widmo 1H NMR aktyny – białka zbudowanego z 375 reszt aminokwasowych

W przypadku większych układów i makromolekuł widma jednowymiarowe nie dostarczają dostatecznych informacji – konieczne staje się zastosowanie technik dwuwymiarowych. Generalnie widma tego typu bazują na dwóch typach oddziaływań: - sprzężenie skalarne – przez wiązanie – badanie struktury, - sprzężenie dipolowe – przez przestrzeń – badania konformacyjne.

Problem przypisania sygnałów na widmie peptydu/białka H3C CH3 Sprzężenie skalarne – poprze wiązania (J-couplings) Oddziaływanie przez przestrzeń - dipolowe (NOE) H C O H N C C N H H

Wielowymiarowy NMR 2D 3D 1D MW ~ 300 MW ~ 10000 MW ~ 30000

Schemat eksperymentu jednowymiarowego:

Eksperyment dwuwymiarowy

W rezultacie otrzymujemy:

Najpopularniejsze eksperymenty dwuwymiarowe Rodzaj badanych oddziaływań zastosowanie COSY COrrelated SpectroscoPY Homo lub heterojądrowe sprzężenie spin-spin Analiza sprzężonych ze sobą atomów DQF COSY Double Quantum Filtered COSY Homojądrowe sprzężenie spin-spin Analiza sprzężonych ze sobą atomów, Pomiar stałych sprzężenia TOCSY TOtal Correlation SpectroscopY Korelowanie ze sobą całych układów spinowych

Heteronuclear Multiple Quantum coherence HMQC Heteronuclear Multiple Quantum coherence Heterojądrowe sprzężenia spin-spin Korelacja przesunięć chemicznych protonów i heteroatomòw związanych przez jedno wiązanie HMBC Heteronuclear Multiple Bond Correlation Korelacja przesunięć chemicznych protonów i heteroatomòw związanych przez kilka wiązań COSY-LR Longrange Correlated SpectroscopY Analiza sprzężeń dalekiego zasięgu

Nuclear Overhauser Effect SpectroscopY NOESY Nuclear Overhauser Effect SpectroscopY Homojądrowe oddziaływania dipolowe Wyznaczanie odległości pomiędzy atomami ROESY Rotating Frame NOESY Wyznaczanie odległości pomiędzy atomami, stosowane w badaniach makromolekul

W badaniach strukturalnych największe znaczenie mają eksperymenty bazujące na sprzężeniach skalarnych – poprzez wiązania. Na podstawie analizy otrzymanych w ten sposób rezultatów możliwe jest przypisanie sygnałòw na widmie a co za tym idzie określenie struktury. A oto kilka przykładów

Widmo HHCOSY β-butyrolaktonu

Widmo HHCOSY kodeiny H-5 —> H-3 —> H-10 —> OH H-10 -> H-9 H-3 —> H-16 H-16 —> H-11

Spektroskopia 13C NMR Metoda ta rozwinęła się stosunkowo niedawno – podstawowe przeszkody we wcześniejszym wykorzystaniu tej techniki stanowiły: - natruralna abundancja izotopu 13C wynosi zaledwie 1.1%, - czterokrotnie mniejsze odstępy poziomów spinowych (w porównaniu do 1H), co w rezultacie daje znacznie mniejszą intensywność sygnałów

Pełne wykorzystanie faktu zjawiska węglowego rezonansu jądrowego umożliwiły: - ulepszenie metodyki i aparatury – wprowadzenie rejestracji widm metodą impulsową z transformacją Fouriera, - wykonywanie widm z rozprzęganiem jąder 13C - brak multipletowości na widmie powoduje zwiekszęnie intensywności sygnałów. W przypadku spektroskopii podstawowym kryterium analizy widm jest przesunięcie chemiczne.

Zakresy przesunięć chemicznych na widmach 13C NMR

Widmo 1H i 13C NMR β-butyrolaktonu

Widmo CHCOSY β-butyrolaktonu

Widmo CHCOSY modyfikowanego glutationu

Widmo HH COSY

HMQC – Heteronuclear Multiple Quantum Coherence Korelacja przesunięć chemicznych protonów związanych z jądrem X przez jedno wiązanie

HMBC – Heteronuclear Multiple Bond Correlation Korelacja przesunięć chemicznych protonów związanych z X przez kilka wiązań

HMQC – Heteronuclear Multiple Quantum Coherence

HMBC – Heteronuclear Multiple Bond Correlation

Widmo HHCOSY i TOCSY reszty aminokwasowej:

2002 – nagroda Nobla z dziedziny chemii - Kurt Wüthrich – pokazał, że strukturę białek można badać za pomocą NMR

Widmo NMR białka

NOESY TOCSY

Widmo NOESY białka

Oddziaływania obserwowane na widmie NOESY

Spektroskopia NMR Przypisanie sygnałów Intensywność Sygnałów NOE Sprzężenia obliczenia dynamiki molekularnej

Magnetic Resonance Imaging – MRI – obrazowanie rezonansem magnetycznym

Na czym polega obrazowanie rezonansem magnetycznym? Obrazowana jest każda warstwa podzielona na komórki “voxels”

We wnętrzu każdej „komórki” jest woda. Jądra 1H w cząsteczkach H2O działają jak małe magnesy

Pod wplywem impulsu elektromagnetycznego o częstości radiowej można zmienić orientację spinów jądrowych N N Kiedy spiny jądrowe powracają do położenia równowagi to jest emitowane promieniowanie radiowe

fast Spiny jądrowe w różnych tkankach powracają do stanu równowagi w różnym czasie. Aby rozróżnić sygnały pochopdzące z różnych tkanek zastosowano pole magnetyczne z gradientem. slow

B0 B1

Obrazowanie bezkontrastowe

Przykładowe związki stosowane jako kontrast w MRI

Obrazowanie jamy brzusznej przy zastosowaniu kontrastu Obrazowanie serca z zastosowaniem kontrastu

Obrazowanie kolana Protony pochodzenia tłuszczowego Protony pochodzące z wody