Metody badań strukturalnych w biotechnologii

Slides:



Advertisements
Podobne prezentacje
Wykład 5: Dyskretna Transformata Fouriera, FFT i Algorytm Goertzela
Advertisements

Wykład III Wykorzystano i zmodyfikowano (za zgodą W. Gawlika)
Wojciech Gawlik - Optyka, 2007/08. wykład 9 1/9 Podsumowanie W8 - Spójność światła ograniczona przez – niemonochromatyczność i niestałość fazy fizyczne.
Analiza falkowa w spektroskopii
MAGNETYCZNA RELAKSACJA JĄDROWA W FAZIE CIEKŁEJ
Efektywna szybkość zaniku magnetyzacji poprzecznej wiąże się z szerokością linii zależnością: w = 1/( T 2 *) = (1/ )R 2 * T 2 * - efektywny T 2, doświadczalny.
Efektywna szybkość zaniku magnetyzacji poprzecznej wiąże się z szerokością linii zależnością: w = 1/( T 2 *) = (1/ )R 2 * T 2 * - efektywny T 2, doświadczalny.
Tajemniczy świat atomu
SPEKTROSKOPIA NMR PODEJŚCIE PRAKTYCZNE
SPEKTROSKOPIA NMR PODEJŚCIE PRAKTYCZNE
Uniwersytet Szczeciński
PROMIENIOWANIE X, A ENERGETYCZNA STRUKTURA ATOMÓW
pomiar NMR spektroskopia impulsowa
Wykład 6 Sprzężenie spin-spin.
Sprzężenie spin-spin Przesunięcie chemiczne
Metody badań strukturalnych w biotechnologii
Czułość pomiarów NMR.
Metody badań strukturalnych w biotechnologii Wykład 1 Wprowadzenie w zagadnienia spektroskopii Spektroskopia w podczerwieni (IR)
Metody badań strukturalnych w biotechnologii
Spektroskopowe metody identyfikacji związków
Metody NMR stosowane w badaniach biopolimerów
Magnetyczny rezonans jądrowy
DIELEKTRYKI TADEUSZ HILCZER
DIELEKTRYKI TADEUSZ HILCZER
WYKŁAD 7 a ATOM W POLU MAGNETYCZNYM cz. 2 (wewnętrzne pola magnetyczne w atomie; poprawki na wzajemne oddziaływanie momentów magnetycznych elektronu; oddziaływanie.
Badanie transportu w biomatrycach lipidowych z zastosowaniem spektroskopii NMR Dorota Michalak Praca magisterska napisana pod okiem dr hab. Marcina Pałysa.
Metody oznaczania biopierwiastków
Wybrane wiadomości z teorii błędów
, Prawo Gaussa …i magnetycznego dla pola elektrycznego…
Podstawowe treści I części wykładu:
PRZYKŁADY Metody obrazowania obiektów
Magnetyczny Rezonans Jądrowy, jego zastosowania i obrazowanie cz. I
Jak widzę cząstki elementarne i budowę atomu?.
Wprowadzenie-węglowodory aromatyczne
MATERIA SKONDENSOWANA
SKANINGOWA MIKROSKOPIA Z ROZDZIELCZOŚCIĄ ATOMOWĄ
Metody badań strukturalnych w biotechnologii
Woda i roztwory wodne. Spis treści Woda – właściwości i rola w przyrodzie Woda – właściwości i rola w przyrodzie Woda – właściwości i rola w przyrodzie.
Fizyka – Transport Energii w Ruchu Falowym
Odkrywanie cząstek elementarnych cześć I
Agnieszka Ilnicka Opieka: dr Joanna Kiryluk prof. Barbara Badełek
 [nm] 800 Podczerwień.
WYKŁAD 2 Podstawy spektroskopii wibracyjnej, model oscylatora harmonicznego i anharmonicznego. Częstość oscylacji a struktura molekuły Prof. dr hab. Halina.
Spektroskopia absorpcyjna
Siły, zasady dynamiki Newtona
Treści multimedialne - kodowanie, przetwarzanie, prezentacja Odtwarzanie treści multimedialnych Andrzej Majkowski informatyka +
___________________________________________________________________________________________________________________________ 1. Wstęp1 Konferencja APES-IES-SEST.
Treści multimedialne - kodowanie, przetwarzanie, prezentacja Odtwarzanie treści multimedialnych Andrzej Majkowski informatyka +
Optyczne metody badań materiałów
Laboratorium Laserowej Spektroskopii Molekularnej PŁ SERS dr inż. Beata Brożek-Pluska.
ZAAWANSOWANA ANALIZA SYGNAŁÓW
Streszczenie W10: dośw. Sterna-Gerlacha (wiązka atomowa – kwantyzacja
Centra NV - optyczna detekcja stanu spinowego
Stany elektronowe molekuł (III)
Szeregi czasowe Ewolucja stanu układu dynamicznego opisywana jest przez funkcję czasu f(t) lub przez szereg czasowy jego zmiennych dynamicznych. Szeregiem.
Program przedmiotu “Opracowywanie danych w chemii” 1.Wprowadzenie: przegląd rodzajów danych oraz metod ich opracowywania. 2.Podstawowe pojęcia rachunku.
Zakaz Pauliego Atomy wieloelektronowe
Modele jądra atomowego Od modeli jądrowych oczekujemy w szczególności wyjaśnienia: a) stałej gęstości materii jądrowej, b) zależności /A od A, c) warunków.
ZASTOSOWANIE SPEKTROSKOPII NMR W MEDYCYNIE
PRZYKŁADY Metody obrazowania obiektów
Chemia jest nauką o substancjach, ich strukturze, właściwościach i reakcjach w których zachodzi przemiana jednych substancji w drugie. Badania przemian.
Wyznaczanie przesunięć chemicznych i stałych ekranowania w jonach NH 4 + za pomocą spektroskopii jądrowego rezonansu magnetycznego Piotr Krajewski V L.O.
SPEKTROSKOPIA MAGNETYCZNEGO REZONANSU JĄDROWEGO (NMR)
Optyczne metody badań materiałów
Optyczne metody badań materiałów
Wiązanie kowalencyjne spolaryzowane
PRZYKŁADY Metody obrazowania obiektów
Podsumowanie W11 Obserwacja przejść rezonansowych wymuszonych przez pole EM jest możliwa tylko, gdy istnieje różnica populacji. Tymczasem w zakresie.
Optyczne metody badań materiałów
Podstawy teorii spinu ½
Zapis prezentacji:

Metody badań strukturalnych w biotechnologii Wykład III Spektroskopia magnetycznego rezonansu jądrowego – podstawowe pojęcia

Magnetyczny rezonans jądrowy – NMR (Nuclear Magnetic Resonance) – podstawą metody jest wykorzystanie właściwości magnetycznych cząsteczek, związanych z występowaniem w nich jąder magnetycznych

Kilka faktów z historii rozwoju NMR: 1946 – wykrycie zjawiska magnetycznego rezonansu jądrowego, 1955 – spektrometry 1H NMR 40MHz, 1965 – opracowanie algorytmu szybkiej transformacji Fouriera (FFT), 1974 – początek rozwoju metod dwuwymiarowych (2D NMR), 1985 – metoda określania III-rzędowej struktury białek w roztworze za pomocą spektroskopii NMR, 1995 – komercyjnie dostępne spektrometry z magnesami nadprzewodnościowymi, umożliwiające wykonanie widm wielowymiarowych o częstości podstawowej 1H NMR 200 – 750 (obecnie do 900) MHz

Normalnie położenie spinów jądrowych jest przypadkowe:

A po przyłożeniu zewnętrznego pola magnetycznego:

Warunek rezonansu:

Warunek rezonansu:

Właściwości jąder atomowych badanych za pomocą NMR: izotop Zawartość procentowa w populacji Kwantowa liczba spinowa jądra I Częstość rezonansowa MHz (B0 = 2.3T) 1H 99.98 ½ 100 13C 1.08 25.1 15N 0.365 10.1 17O 3.7•10-2 5/2 13.5 19F 94 31P 40.5

Metody rejestracji widm NMR: Metoda fali ciągłej – CW (continuous wave), Metoda impulsowa, znacznie lepsza i nowocześniejsza, polegajaca na rejestracji FID (Free Induction Delay) i zastosowaniu transformacji Fouriera do jego obróbki

Metoda fali ciągłej

Metoda impulsowa FID w funkcji czasu → widmo uzyskane po transformacji Fouriera

FT NMR

1H NMR – protonowy rezonans magnetyczny Na powszechne zastosowanie tej metody składa sie kilka zalet: łatwość przygotowania próbki, wymagana niewielka ilość związku (10-6 g), krótki czas pomiaru – rzędu kilku minut

Na podstawie jednowymiarowych widm protonowych można wnioskować o budowie prostych związków. Cały problem sprowadza się do określenia trzech wielkości: Wartości przesunięć chemicznych poszczególnych sygnałów na widmie. Multipletowości sygnałów (sprzężenie spin – spin). Intergracja sygnałów.

Przesunięcie chemiczne Na jądro atomowe działa pole mniejsze od przyłożonego pola zewnętrznego – tzw efekt ekranowania, która jest tym większy im większa jest gęstość elektronowa wokół danego jadra: Bef = B0(1 – σ) σ – stała ekranowania Dzięki temu na widmie obserwujemy zróżnicowanie sygnałów w zależności od otoczenia chemicznego protonów.

Przesunięcie chemiczne Bef = B0(1 – σ) σ – stała ekranowania

Różnica stałych ekranowania wzorca i próbki nosi nazwę przesunięcie chemiczne δ, wyrażane jest w ppm (part per milion): δ = B0WZ – B0PR/B0WZ•106 [ppm] Ponieważ z warunku rezonansu wynika, że B0 i ν są do siebie proporcjonalne, zatem: δ = νpr- νwz/νwz•106 Najczęściej stosowanym wzorcem w 1H NMR jest tetrametylosilan (TMS).

Przesunięcie chemiczne Grupa δ [ppm] R-COOH R-COH Ar-H R-OH R-NH2 =CH- -CH2- -CH3 12 –10 11 – 9 9 – 7 6 - 4 4 – 2 6 – 1 5 – 1 3 - 1

Przesunięcie chemiczne

Przesunięcie chemiczne

Dlaczego na widmach NMR pojawiają się multiplety? NH2 CH3

Sprzężenia spinowo-spinowe Kolejnym elementem ułatwiającym analizę widm NMR są sprzężenia spinowo-spinowe, wynikające z oddziaływań momentów magnetycznych jąder. Efektem tego jest podział sygnału na multiplet, ilość linii w multiplecie opisuje wzór: P = 2nI + 1 gdzie: n – liczba równocennych jąder rozszczepiających, I – kwantowa liczba spinowa

sprzężenia spinowo-spinowe

sprzężenia spinowo-spinowe

Liczba równocennych jąder Ilość i intensywności sygnałów w multiplecie dla I = ½: Liczba równocennych jąder Ilość i intensywności sygnałów w multiplecie 1 2 3 4 5 6 1 1 1 2 1 1 3 3 1 1 4 6 4 1 1 5 10 10 5 1 1 6 15 20 15 6 1

Równocenne protony

Ostatnim czynnikiem istotnym w analizie protonowego rezonansu magnetycznego jest krzywa integracji. W przypadku 1H NMR powierzchnia piku jest wielkością wprost proporcjonalą do ilości protonów od których dany pik pochodzi.

Przykład widma 1H NMR: