Derywatyzacja enzymatyczna w elektroforezie kapilarnej

Slides:



Advertisements
Podobne prezentacje
ZJAWISKO FIZYCZNE A REAKCJA CHEMICZNA
Advertisements

SOLE JAKO PRODUKT REAKCJI WODNYCH ROZTWORÓW KWASÓW I ZASAD
Stała równowagi reakcji Izoterma van’t Hoffa
EU (J) energia ultradźwięków PU = E / t (J/s = W) moc ultradźwięków
Kinetyka reakcji enzymatycznych Enzymologia-9. Metody pomiaru szybkości reakcji enzymatycznych: reakcje sprzężone D -Glc + ATP D -Glc-6-P + ADP D-Glc-6-P.
Efekty mechano- chemiczne
„Bielenie ozonem dżinsowych wyrobów”
OPTOELEKTRONIKA Temat:
Scenariusz lekcji dla klasy II liceum ogólnokształcącego
Materiały pochodzą z Platformy Edukacyjnej Portalu
UNIKANIE WYPADKÓW w pracowni chemicznej
Drogi Uczniu!!!!!! Jeżeli oglądasz prezentację to znaczy, że znasz już wszystkie typy reakcji chemicznych i umiesz je rozpoznawać! Aby ułatwić Ci przyswajanie.
Określanie mechanizmów reakcji enzymatycznych
Określanie mechanizmów reakcji enzymatycznych
Biotechnologie pozyskiwania źródeł energii odnawialnej
Desorpcja wodoru w stopach palladu modelowym układzie elektrody ujemnej w ogniwach wodorkowych. Ewa Kalinowska Pracownia Elektrochemicznych Źródeł Energii.
1,3–DIPOLARNA CYKLOADDYCJA TLENKU MEZYTYLONITRYLU DO CHIRALNYCH OLEFIN
Wpływ per[2,3,6-tri-O-(2’-metoksy)etylo]-α-cyklodekstryny na katalityczną aktywność L-tryptofan indol liazy Praca magisterska wykonana w Pracowni Węglowodanów,
` Eliminacja interferencji izobarycznych selenu, arsenu i antymonu
Addycje Grignarda do chiralnych pochodnych kwasu fenyloglioksalowego
Uniwersytet Warszawski Pracownia Radiochemii
Enzymatyczne utlenianie alkoholi pierwszorzędowych
ENZYMATYCZNE OZNACZANIE WYBRANYCH PESTYCYDÓW I  AFLATOKSYN ORAZ PRODUKTÓW ICH ROZKŁADU RADIOLITYCZNEGO Angelika Gałęzowska Kierownik pracy: prof.
Agata Granis KONSTRUKCJA I WŁAŚCIWOŚCI BIOCZUJNKA AMPEROMETRYCZNEGO
Kierownik i opiekun pracy: dr inż. J. Skupińska WSTĘP Reakcje karbonylowania nitrozwiązków są doskonałą alternatywą dla reakcji z zastosowaniem toksycznego.
w 0.5 mol dm-3 H2SO4 przy szybkości wirowania 1600 obr. min.-1
Magdalena Bodziachowska Pracownia Elektrochemicznych Źródeł Energii
Poziom stężeń analitów w moczu (literatura) [mg/L]
Oddziaływanie pomiędzy modyfikowanymi cyklodekstrynami a L-tryptofan indol liazą. Praca magisterska wykonana w Pracowni Węglowodanów,
Wpływ zmiennych środowiskowych na reakcje [4+2]cykloaddycji z użyciem chiralnych pochodnych kwasu akrylowego Karolina Koszewska Kierownik i opiekun pracy:
Polimer fullerenowy z centrami metalicznymi jako matryca biosensorowa
Gęstość, lepkość i funkcje nadmiarowe mieszanin tert-butanolu z n-butanolem, sec-butanolem i izo-butanolem. Wartości gęstości i lepkości kinematycznej.
Pracownia Teoretycznych Podstaw Chemii Analitycznej
Elektrochemiczne właściwości metalicznego renu
Wpływ szybkości przepływu próbki Analiza wód naturalnych
Uniwersytet Warszawski Wydział Chemii Barbara Zalewska
Badanie właściwości fizykochemicznych mieszanin pierwszo- i drugorzędowych butanoli. Anna Milewska Uniwersytet Warszawski Zakład Fizyki i Radiochemii Kierownik.
Analiza specjacyjna platyny w próbkach roślinnych
Reaktory membranowe.
Temat lekcji: Wykrywamy związki organiczne w pokarmach.
Cukrzyca to grupa chorób metabolicznych o różnej etiologii, charakteryzująca się przewlekłą hiperglikemią spowodowaną zaburzeniami wydzielania lub działania.
Seminarium 2 Krzywe kalibracyjne – rodzaje, wyznaczanie, obliczanie wyników Równanie regresji liniowej Współczynnik korelacji.
WPŁYW pH i SIŁY JONOWEJ NA LEPKOŚĆ ROZTWORÓW POLIELEKTROLITÓW
ENZYMY.
Metabolizm i produkty przemiany materii
PRACOWNIA FIZYKOCHEMICZNYCH PODSTAW TECHNOLOGII CHEMICZNEJ
CHEMIA ORGANICZNA WYKŁAD 13.
Aldehydy.
Zapraszam do oglądania prezentacji
Skala ph.
Cukier - wróg czy przyjaciel?
Kwantowe nanostruktury półprzewodnikowe do zastosowań w biologii i medycynie - Rozwój i komercjalizacja nowej generacji urządzeń diagnostyki molekularnej.
Projekt współfinansowany ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego CZŁOWIEK – NAJLEPSZA INWESTYCJA Projekt „Naukowy zawrót.
   BARBARA KUKUŁA PRÓBY OPRACOWANIA NOWEJ METODY SYNTEZY KOMPLEKSÓW MIEDZI(II) Z ALKOHOLAMI DIAZOLOWYMI.
U NIWERSALNE S PEKTROFOTOMETRY UV-VIS Pomiary absorbancji w zakresie nm z krokiem 1 nm za pomocą monochromatora 10” dotykowy wyświetlacz, który.
1 Szkoła Letnia STC — Łódź 2011 OBOWIAZUJĄCE AKTY PRAWNE DOTYCZĄCE JAKOŚCI PŁYNNYCH ROZTWORÓW SACHAROZY Dr inż. Krystyna Lisik.
Próba zastosowania metody Lowry’ego do oznaczania białka w sokach surowych dr Bożena Wnuk.
Wpływ modyfikacji cząstek montmoryllonitu na właściwości termiczne kompozytów z kauczuku silikonowego.
ROZKŁAD WYBRANYCH ZWIĄZKÓW FARMACEUTYCZNYCH W PROCESIE UV BEZ I Z DODATKIEM TiO 2 Politechnika Śląska Wydział Inżynierii Środowiska i Energetyki Instytut.
Metoda naukowa i wyjaśnianie świata
Synteza Heksanitrostilbenu (HNS) Agnieszka Wizner Bogumiła Łapińska Agnieszka Naporowska Rafał Bogusz Maciej Wiatrowski Opiekun pracy: dr inż. Paweł MaksimowskiZakład.
Szybkość i rząd reakcji chemicznej
Otrzymywanie kwasu asparaginowego jako surowca dla przemysłu farmaceutycznego w skali t/rok. Tomasz Jaskulski, Wiktor Kosiński, Mariusz Krajewski.
Rys. 1 Cząsteczka fenolu. Fenol (hydroksybenzen) jest to organiczny związek chemiczny, najprostszy związek z grupy fenoli. Od alkoholi odróżnia go fakt,
Synteza kwasu azotowego z zastosowaniem technik
Szybkość reakcji i rzędowość reakcji
Wykład 5.
średnia masa cząsteczkowa: liczbowa wagowa polidyspersja
Kreacja aromatów Techniki przygotowania próbek
Analiza gazowa metody oparte na pomiarze objętości gazów,
Zapis prezentacji:

Derywatyzacja enzymatyczna w elektroforezie kapilarnej Pracownia Analizy Przepływowej i Chromatografii Kierownik pracy: prof. dr hab. Marek Trojanowicz Opiekun pracy: dr Ewa Poboży Ignacy Rzygaliński Wprowadzenie ABTS jako substrat peroksydazy chrzanowej (HRP) β-NADH jako substrat peroksydazy chrzanowej (HRP) GOx GOx Przedmiotem pracy było opracowanie metody derywatyzacji enzymatycznej w wysokosprawnej elektroforezie kapilarnej z detekcją spektrofotometryczną w celu ilościowego oznaczania substratów oksydaz. Reakcje derywatyzacji enzymatycznej przeprowadzano bezpośrednio w kapilarze, stanowiącej swoisty mikroreaktor zgodnie z opisaną wcześniej w literaturze procedurą EMMA (Electrophoretically Mediated Microanalysis). Stosowano różne sposoby prowadzenia reakcji - metodę ciągłego kontaktu reagentów, jak i metodę przenikających się stref. Wykorzystano układ bienzymatyczny oksydaza – peroksydaza z różnymi markerami detekcji oznaczanego związku. Jako związek modelowy wybrano glukozę w celu jej ilościowego oznaczenia jako substratu reakcji utleniania w obecności oksydazy glukozowej (GOx). Zbadano trzy rodzaje układów pozwalających na uzyskanie sygnału spektrofotometrycznego, przy czym zawsze pierwszą reakcją zachodzącą w układzie była: D-glukoza + O2 D-glukono-1,5-lakton + H2O2 Następna reakcja enzymatyczna miała na celu umożliwienie spektrofotometrycznej detekcji powstającego nadtlenku wodoru. W tym celu zastosowano drugi enzym, peroksydazę chrzanową (HRP), która katalizuje reakcje utleniania różnych związków za pomocą H2O2. Wykorzystano trzy różne substraty peroksydazy chrzanowej: kwas 2,2’-azyno-bis(3-etyleno-tiazolino-6-sulfonowy) (ABTS); dinukleotyd nikotyno-amidoadeninowy w formie zredukowanej (NADH) oraz 1,2,3-trihydroksybenzen (pirogalol). W zależności od właściwości absorpcyjnych powstających produktów, detekcję prowadzono przy różnej długości fali. Sygnał uzyskiwany od powstającego produktu jest proporcjonalny do zawartości D-glukozy w próbce. W warunkach takich możliwe są oznaczenia glukozy w zakresie stężeń od 0,005 do 0,1 mmol/L. D-Glukoza + O2 D-Glukono-1,5-lakton + H2O2 H2O2 + ABTS(red) H2O + ABTS(ox) ABTS(ox) + β-NADH ABTS(red) + β-NAD D-Glukoza + O2 D-Glukono-1,5-lakton + H2O2 H2O2 + β-NADH H2O + β-NAD HRP HRP detekcja l = 260 nm Metoda ciągłego kontaktu reagentów detekcja l = 260 nm β-NAD Metoda ciągłego kontaktu reagentów Metoda klasyczna strefa - strefa Wstrzyknięcie: GOx (75 U/ml) HRP (488 U/ml) ABTS(red) (1 mM) BGE: HEPES (30 mM, pH=7) β-NADH (1mM) GLUKOZA Wstrzyknięcie: GOx (75 U/ml) HRP (488 U/ml) ABTS(red) (1 mM) BGE: HEPES (30 mM pH=7) Przykładowe elektroferogramy zarejestrowane dla różnych stężeń glukozy β-NADH (1 mM) GLUKOZA β-NAD Reakcja u wlotu kapilary β-NAD Optymalizacja czasu inkubacji GOx β-NAD Przykładowe elektroferogramy zarejestrowane dla różnych stężeń glukozy Przykładowe elektroferogramy zarejestrowane dla różnych stężeń glukozy Zależność powierzchni piku uzyskiwanego sygnału od czasu inkubacji u wlotu kapilary Przykładowe elektroferogramy dla różnych stężeń glukozy (czas inkubacji 3 min) Trudności obserwowane np. brak liniowości uzyskiwanego sygnału wynikają z: reakcji ubocznych utleniania ABTS(red) tlenem reakcji ubocznych utleniania NADH w obecności HRP zarówno H2O2, jak i tlenem Zależność powierzchni piku od stężenia glukozy (0,001-0,1 mM) Metoda EMMA (Electrophoretically mediated microanalysis) Pirogalol jako substrat peroksydazy chrzanowej (HRP) Różne sposoby prowadzenia reakcji enzymatycznej w kapilarze: Metoda ciągłego kontaktu (continous mode) Zastosowanie β-NADH jako bezpośredniego substratu peroksydazy chrzanowej pozwoliło ograniczyć układ do dwóch reakcji. Nie udało się wyeliminować problemów związanych z niepożądanymi reakcjami ubocznymi utleniania β-NADH również tlenem, a nie tylko powstającym w wyniku pierwszej reakcji nadtlenkiem wodoru. GOx D-Glukoza + O2 D-Glukono-1,5-lakton + H2O2 ENZ HRP Substrat znajduje się w BGE, zaś enzym wstrzykiwany jest w postaci strefy Substrat w BGE Substrat w BGE Część eksperymentalną pracy magisterskiej wykonano na przyrządzie do elektroforezy kapilarnej Beckman P/ACE MDQ z matrycowym detektorem diodowym UV-Vis. detekcja l = 304 nm pirogalol purpurogalina Warunki rozdzielania Kapilara niemodyfikowana : l = 50 / 60 cm; i.d.=75 µm. Napięcie: +30 kV. Temperatura: +35,7 °C. Wstrzykiwanie hydrodynamiczne. Roztwory wzorcowe pirogalolu i purpurogaliny Reakcja u wlotu kapilary Metoda przenikających się stref (plug-plug mode) Metoda klasyczna strefa–strefa (classic plug–plug) Reakcja u wlotu kapilary (at-inlet reaction) pirogalol purpurogalina enzymy Wnioski Pierwszy wsztrzykiwany jest reagent wolniejszy 3 min 304 nm Podjęto próbę derywatyzacji enzymatycznej w elektroforetycznych oznaczeniach glukozy z zastosowaniem oksydazy glukozowej i 3 różnych substratów peroksydazy chrzanowej. Dla dwóch z nich - ABTS i ß-NADH - uzyskano sygnały umożliwiające ilościowe oznaczenie glukozy. Zastosowanie pirogalolu nie przyniosło oczekiwanych rezultatów. W przypadku wykorzystania ABTS jako substratu HRP konieczne jest przeprowadzenie dodatkowej reakcji. Zastosowanie ß-NADH jako substratu peroksydazy znacznie uprościło układ, pozwalając tym samym na uzyskanie lepszych wyników. Nie udało się jednak wyeliminować trudności związanych z ubocznymi reakcjami utleniania ß-NADH tlenem. 1 min SUB 214 nm ENZ INKUBACJA EOF EOF Elektroferogramy roztworu wzorcowego mieszaniny pirogalolu i purpurogaliny Elektroferogramy zarejestrowane dla różnych czasów inkubacji u wlotu kapilary BGE BGE BGE BGE - - + + Nie udało się uzyskać oczekiwanego sygnału od purpurogaliny. Widoczne jest tylko zgrubienie mogące pochodzić od strefy powstającego produktu. PROD PROD