Wykrywanie wirusa Y ziemniaka w bulwach i kiełkach

Slides:



Advertisements
Podobne prezentacje
Wprowadzenie do metodologii eksperymentu biologicznego.
Advertisements

ROLA I ZADANIA OCHRONY ROŚLIN W NOWOCZESNYM ROLNICTWIE CHOROBY ROŚLIN
Ocena wartości diagnostycznej testu – obliczanie czułości, swoistości, wartości predykcyjnych testu. Krzywe ROC. Anna Sepioło gr. B III OAM.
Polimorfizmy genu TNF- u chorych na reumatoidalne zapalenie stawów
Broń biologiczna.
materiał specjalny Kwartalnika Edukacja Biologiczna i Środowiskowa
PRZEDSIĘBIORCZY NAUKOWIEC PRZEDSIĘBIORCZA KOBIETA NAUKOWIEC
umed.lodz.pl/klinika-zakazna
Zapoznaj się z informacjami zawartymi na podanych stronach internetowych i uzupełnij definicję.
Statystyka w doświadczalnictwie
Epidemiologia chorób roślin
Wirusy, fitoplazmy i bakterie właściwe chorobotwórcze dla roślin
Alternatywne źródła energii - energia słoneczna
POSTĘP BIOLOGICZNY I TECHNIOLOGIE PRODUKCJI ZWIERZĘCEJ W WARUNKACH ZMIENIAJĄCEGO SIĘ KLIMATU I Kongres Nauk Rolniczych Puławy, maj 2009 r.
Przyczyny zróżnicowania wyników działalności produkcji roślinnej prowadzonych metodami konwencjonalnymi mgr inż. Izabela Ziętek.
INFEKCYJNE CZYNNIKI CHOROBOTWÓRCZE
ROŚLINY WSKAŹNIKOWE (BIOINDYKATORY)
KONFERENCJA NAUKA DLA BIZNESU – WSPARCIE INNOWACJI W SEKTORZE ROLNO-SPOŻYWCZYM Katarzyna Margel Warszawa, SGGW, 27 luty 2007 rok.
KONFERENCJA NAUKA DLA BIZNESU – WSPARCIE INNOWACJI W SEKTORZE ROLNO- SPOŻYWCZYM prof. dr hab. Alojzy Szymański Warszawa, SGGW, 27 luty 2007 r.
Inwazyjna choroba meningokokowa
Nasiennictwo ziemniaka wybrane zagadnienia
Przyczyny chorób zakaźnych i ich skutki
Marta Molińska-Glura, Krzysztof Moliński Wisła, grudzień 2010
ROLA INSTYTUTÓW BADAWCZYCH EUROPEJSKI KONGRES GOSPODARCZY 2011
na podstawie materiału – test z użyciem komputerowo generowanych prób
„Wykorzystanie analiz DNA w celu identyfikacji osobniczej
Tomasz Krasiński Felicyta Walczak Maciej Gałęzewski
RAK SZYJKI MACICY.
OEM S INSTYTUT OGRODNICTWA ZAKŁAD DOŚWIADCZALNY OŚRODEK ELITARNEGO MATERIAŁU SZKÓŁKARSKIEGO PRUSY GŁUCHÓW tel. (0-46) , (0-46) ,
Dnia r. mieliśmy okazję przeprowadzić wywiad z panią Iwoną Ziętkiewicz, która prowadzi rodzinną spółkę a mianowicie sad wiśniowy. Nasze pytania.
Pojęcia biologiczne: GENETYKA - nauka o dziedziczności i zmienności.
Właściwości testów diagnostycznych
Diagnostyka laboratoryjna nowotworów
Formuły cenowe.
STRATEGICZNY PROGRAM BADAWCZY PPT – BPP
Biotechnologia.
na podstawie rozporządzenia Ministra Rolnictwa i Rozwoju Wsi
Informacja o realizacji zadań z zakresu diagnostyki laboratoryjnej wykonanej w WIORiN w Bydgoszczy za okres
ZASTOSOWANIE ORGANIZMÓW
umed.lodz.pl/klinika-zakazna
CHOROBY WEKTOROWE.
Średni plon odmiany pszenicy ozimej KBH 1261/00 - KOHELIA w % wzorca w poszczególnych rejonach kraju w latach na poziomie a1.
Pszenżyto (Triticale)
KATEGORIA: Zak ł ady rolne Informacja nt. laureatów Konkursu Bezpieczne Gospodarstwo Rolne 2015.
EKSPERYMENTY I OBSERWACJE NA LEKCJACH BIOLOGII I PRZYRODY
(acquired immune deficiency syndrome)
1 Zakład Mikrobiologii Stosowanej, Instytut Mikrobiologii, Wydział Biologii, Uniwersytet Warszawski, Warszawa 2 Zakład Mykologii, Katedra Mikrobiologii,
Diagnostyka, objawy i leczenie zakażenia wirusem HCV
Pozytywne i negatywne znaczenie bakterii
Wpływ wyciągów z czosnku zwyczajnego i sosny pospolitej na proces pleśnienia przygotował: Tomasz Klaus pod opieką: mgr Marii Rubacha.
Oddział w Radomiu Pokazowe Gospodarstwo Ekologiczne w Chwałowicach Cedzyna 2012.
WYNIKI DOŚWIADCZEŃ DEMONSTRACYJNYCH NAD ZWALCZANIEM PATOGENÓW GLEBOWYCH W UPRAWIE WARZYW, PRZEPROWADZONYCH W RAMACH PROJEKTU LIFE W ROKU 2011 Czesław Ślusarski.
DAP & MAP UPDATE Konferencja Farmer, Warszawa Grudzień 2013 przełomem w nawożeniu azotowym.
ZAKŁAD RACHUNKOWOŚCI ROLNEJ PRZESTAWIANIE GOSPODARSTWA ROLNEGO NA METODY PRODUKCJI EKOLOGICZNEJ mgr inż. Marcin Żekało.
ZAKŁAD RACHUNKOWOŚCI ROLNEJ Standardy produkcji ekologicznej i nadwyżka bezpośrednia wybranych produktów rolniczych w 2005 roku mgr inż. Grażyna Nachtman,
Światowy Dzień Zdrowia 2015 BEZPIECZEŃSTWO ŻYWNOŚCI Powiatowa Stacja Sanitarno – Epidemiologiczna w Zielonej Górze Promocja Zdrowia i Oświata Zdrowotna.
Produkcja papryki w regionie radomskim. Historia uprawy -Pierwsze próby uprawy papryki w regionie radomskim odbyły się w latach osiemdziesiątych na terenie.
Produkcja papryki w rejonie radomskim. Historia uprawy -Pierwsze próby uprawy papryki w regionie radomskim odbyły się w latach osiemdziesiątych na terenie.
Martyna Furtak kl. 1 TT. (Genetically Modified Organisms), to organizmy których geny zostały celowo zmienione przez człowieka. Według art. 3 ustawy z.
G.M.O.- korzyści i zagrożenia
Joanna Szczypta I TE. Organizmy zmodyfikowane genetycznie w skrócie GMO (ang. Genetically Modified Organisms) to organizmy, których geny zostały celowo.
C ENTRUM BIOLOGII MOLEKULARNEJ I BIOTECHNOLOGII. Zespół Pałacowo-Parkowy Uniwersytetu Szczecińskiego w Małkocinie Lokalizacja CBMiB Katedra Biologii Komórki.
ORGANIZMY ZMODYFIKOWANE GENETYCZNIE
Wykonała: Barbara Minczewska
PNO, czyli porozmawiajmy o odporności. Co to jest odporność? Odporność jest wynikiem pracy wielu skomplikowanych elementów, które tworzą nasz układ immunologiczny.
Nisza ekologiczna chwastów w zależności od odmian zbóż jarych
Izotermiczna amplifikacja kwasów nukleinowych jako szybki test wykrywania wirusów ziemniaka na przykładzie wirusa PVY mgr inż. Joanna Chołuj, mgr inż.
Sytuacja epizootyczna w zakresie wirusowych chorób ryb
Propozycje działań demonstracyjnych
Zapis prezentacji:

Wykrywanie wirusa Y ziemniaka w bulwach i kiełkach Krzysztof Treder, Joanna Chołuj, Anna Pawłowska, Marta Dybner Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Biochemii Zakład Nasiennictwa i Ochrony Ziemniaka w Boninie Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin – Państwowy Instytut Badawczy

Wirus Y ziemniaka Przedstawiciel Potywirusów Przenoszony w sposób nietrwały przez mszyce oraz mechanicznie Groźny patogen ziemniaków, pomidorów i papryki Duża zmienność genetyczna Klasyczne szczepy: nekrotyczny (N) i zwyczajny (O) Szczepy rekombinacyjne: NTN, N-Wi, N:O Zróżnicowane objawy chorobowe na liściach i bulwach Straty plonu do 88%1 1 - Chrzanowska M. 1985. Symptomatologia chorób wirusowych ziemniaka. [W:] Biologia ziemniaka. Pod red. W. Gabriela. PWN Warszawa: 279-296;

Mozaika – a, ostra mozaika – b, mozaika i punktowe przejaśnienia liści – c, systemiczne nekrozy i nekrozy nerwów widoczne na górnej – e i dolnej – f stronie liścia, syndrom opadania liści – f, nekrotyczna pierścieniowa choroba bulw (PTNRD) - g i h. Karasev A. i Gray S. 2013. Annu. Rev. Phytopathol. 51: 571–86.

Próba oczkowa Zalety: metoda dobrze sprawdzona wiarygodna Czuła Wady: Wieloetapowa i długotrwała Uprawa roślin potomnych w szklarni koszty ogrzewania i doświetlania Fot.: dr hab. Sławomir Wróbel

Ocena wpływu odporności odmian ziemniaka na skuteczność wykrywania PVY w bulwach i kiełkach

Lata 2012-2014 sadzeniaki wolne od wirusów obsada z roślin porażonych PVY trzy bulwy spod krzaka badanie bulw, kiełków i potomnych roślin Odmiana Odporność* Quincy 3-4 Irys 5-6 Zeus 7-8 Korona 9 * – skala 9-stopniowa: 9 – odporność najwyższa; 1 – odporność najniższa

Średnie porażenie PVY z trzylecia B

Doświadczenie polowe wykonane w IHAR-PIB, ZNiOZ Bonin w roku 2015  2015 PVY Odmiana Liczba roślin Odporność* B K O Quincy 29 3-4 5 Krasa 30 4 13 28 Fresco 14 Irys 5-6 22 25 Zeus 7-8 Finezja 19 9 *- skala 9-stopniowa: 9 – odporność najwyższa; 1 – odporność najniższa B – bulwy; K – kiełki z oczek; O – liście roślin z oczek (próba oczkowa)

Zależność stopnia porażenia odmian ziemniaka PVY od poziomu odporności odmian Na osi X, pod nazwami odmian podano ich odporności na dany wirus. Procent porażenia określano ze stosunku liczby roślin porażonych do całkowitej liczby badanych roślin

Wnioski Wzrost odporność odmian negatywnie wpływa na wykrywalność PVY w bulwach Odporność odmian nie wpływa znacząco na wykrywalność PVY w kiełkach

Wykrywaniem wirusów w bulwach i kiełkach ziemniaka ocena przydatności kiełków do wykrywania PVY testem ELISA ocena przydatności RT-PCR w czasie rzeczywistym (RT-qPCR) do wykrywania PVY w bulwach

Porównanie skuteczności wykrywania wirusów w bulwach i w kiełkach z próbą oczkową   I II III Suma Liczba roślin 90 270 Oczkowa 39 80 68 219 % 43,3 88,9 75,6 81,1 Bulwy Koktajl 35 41 156 38,9 45,6 57,7 Zgodne 59 135 Kiełki Koktajl 37 76 82 195 41,1 84,4 91,1 72,2 75 62 174 Kiełki DAS 36 74 190 40,0 82,2 70,4 169

RT-PCR w czasie rzeczywistym (RT-qPCR)

Porównanie czułości immunologicznego testu DAS-ELISA z testami molekularnymi

Ocena przydatności testu RT-qPCR do wykrywania PVY w bulwach Porównanie skuteczności wykrywania PVY w bulwach ziemniaka testem RT-qPCR z próbą oczkową oraz z badaniem ekstraktów z kiełków i z bulw za pomocą testu ELISA. Liczby nad słupkami oznaczają liczbę roślin porażonych/całkowitą liczbę badanych roślin.

Wnioski Potwierdzono dobrą zgodność wykrywania PVY w kiełkach z próbą oczkową (test ELISA). Za pomocą RT-qPCR wykryto PVY w 4-krotnie mniejszej liczbie bulw niż stosując próbę oczkową. Konieczne jest opracowanie skutecznej metody izolacji RNA z bulw.

Podziękowania dr hab. Jarosław Tyburski, Interdyscyplinarne Centrum Nowoczesnych Technologii, UMK Toruń. dr hab. Sławomir Wróbel, Europlant. Badania finansowane przez Ministerstwo Rolnictwa i Rozwoju Wsi w ramach programu Postęp Biologiczny w Produkcji Roślinnej (zadanie 58 pt.: Opracowanie czułych metod wykrywania najważniejszych wirusów ziemniaka).