Kinetyka membran biologicznych - zmienność w stałości

Slides:



Advertisements
Podobne prezentacje
TERMODYNAMIKA CHEMICZNA
Advertisements

Technika wysokiej próżni
Podsumowanie W2 Widmo fal elektromagnetycznych
WYKŁAD 8 Rozpuszczalność ciał stałych w cieczach
ENTALPIA - H [ J ], [ J mol -1 ] TERMODYNAMICZNA FUNKCJA STANU dH = H 2 – H 1, H = H 2 – H 1 Mgr Beata Mycek - Zakład Farmakokinetyki i Farmacji Fizycznej.
Dr inż. Piotr Bzura Konsultacje: PIĄTEK godz , pok. 602 f
WYKŁAD 6 ATOM WODORU W MECHANICE KWANTOWEJ (równanie Schrődingera dla atomu wodoru, separacja zmiennych, stan podstawowy 1s, stany wzbudzone 2s i 2p,
Elementy Modelowania Matematycznego
Nowe wyniki w fizyce zapachu
1 Stan rozwoju Systemu Analiz Samorządowych czerwiec 2009 Dr Tomasz Potkański Z-ca Dyrektora Biura Związku Miast Polskich Warszawa,
Kierownik: prof. dr hab. Adam Patkowski Web”master” dr Jacek Gapiński
DIELEKTRYKI TADEUSZ HILCZER
Statystyka w doświadczalnictwie
Luminescencja w materiałach nieorganicznych Wykład monograficzny
TERMOCHEMIA.
TERMOCHEMIA.
Wykład III Fale materii Zasada nieoznaczoności Heisenberga
Wykład Równanie Clausiusa-Clapeyrona 7.6 Inne równania stanu
Systemy dynamiczneOdpowiedzi systemów – modele różniczkowe i różnicowe Kazimierz Duzinkiewicz, dr hab. inż.Katedra Inżynierii Systemów Sterowania 1 Systemy.
Dane INFORMACYJNE Nazwa szkoły:
FIZYKA dla studentów POLIGRAFII Układy i procesy termodynamiczne
FIZYKA dla studentów POLIGRAFII Przejścia fazowe Zjawiska transportu
Wykład GRANICE FAZOWE.
Neutrina z supernowych
Podstawowe pojęcia akustyki
Wykład 5 Dynamika molekularna
Zakład Chemii Medycznej Pomorskiej Akademii Medycznej
Chemia stosowana I temat: równowaga chemiczna.
Plan Jak wygląda szczelina skalna?
Przykładowe zastosowania równania Bernoulliego i równania ciągłości przepływu 1. Pomiar ciśnienia Oznaczając S - punkt spiętrzenia (stagnacji) strugi v=0,
RÓWNOWAGA WZGLĘDNA PŁYNU
Część eksperymentalna konkursu:
Zjawisko EPR Struktura i własności kryształu LGT Widma EPR Wnioski
Nowości w fizyce zapachu
Piotr Rybiński. 1. Wstęp 2. Opis systemu i narzędzi 3. Algorytm 4. Przykłady działania 5. Porównanie z rzeczywistym systemem rozwoju 6. Rozszerzenia systemu,
„Woda w liczbach” Wiktor Niparko.
PROCES TECHNOLOGICZNY WYKONANIA ODLEWU W FORMIE PIASKOWEJ
Podstawy automatyki 2012/2013Transmitancja widmowa i charakterystyki częstotliwościowe Mieczysław Brdyś, prof. dr hab. inż.; Kazimierz Duzinkiewicz, dr.
Kinetyka reaktora i generacja ciepła
AUTOMATYKA i ROBOTYKA (wykład 5)
Podstawy Biotermodynamiki
Plan prezentacji Zarys projektu Geneza tematu
Wykład 8 Statyczne i astatyczne obiekty regulacji
Podstawy mechaniki płynów - biofizyka układu krążenia
Wytrzymałość materiałów Wykład nr 8
TERMODYNAMIKA – PODSUMOWANIE WIADOMOŚCI Magdalena Staszel
Treści multimedialne - kodowanie, przetwarzanie, prezentacja Odtwarzanie treści multimedialnych Andrzej Majkowski informatyka +
Kinetyczna teoria gazów
Mgr inż. Paweł Ziółkowski
Treści multimedialne - kodowanie, przetwarzanie, prezentacja Odtwarzanie treści multimedialnych Andrzej Majkowski informatyka +
Treści multimedialne - kodowanie, przetwarzanie, prezentacja Odtwarzanie treści multimedialnych Andrzej Majkowski informatyka +
Seminarium 2 Elementy biomechaniki i termodynamiki
D. Ciołek EKONOMETRIA – wykład 5
Rozkład Maxwella i Boltzmana
USG Monika Kujdowicz.
Andrzej J. Wojtowicz wyklad monograficzny 1 Luminescencja w materiałach nieorganicznych Wykład monograficzny AJ Wojtowicz Instytut Fizyki UMK Zakład Optoelektroniki.
Andrzej J. Wojtowicz wyklad monograficzny 1 Luminescencja w materiałach nieorganicznych Wykład monograficzny AJ Wojtowicz Instytut Fizyki UMK Zakład Optoelektroniki.
Entropia gazu doskonałego
1 Klasyfikacja przemian fazowych Współczesna klasyfikacja przemian fazowych Landaua-Ginsburga (ok. 1970), będąca uogólnieniem klasyfikacji Ehrenfesta (1933)
Zajęcia 4-5 Gęstość i objętość. Prawo gazów doskonałych. - str (rozdziały 2 i 3, bez 2.2) - str (dot. gazów, przykłady str zadania)
ABSORPCJA, ZATĘŻANIE1 TERMODYNAMIKA TECHNICZNA I CHEMICZNA WYKŁAD VIII WYKŁAD VIII ABSORPCJA, ZATĘ ż ANIE.
Optyka falowa – podsumowanie
Równowaga cieczy i pary nasyconej
Transport w organach i organizmie. Modele kompartmentowe.
USG Monika Kujdowicz.
Statyczna równowaga płynu
Napięcie powierzchniowe
Treści multimedialne - kodowanie, przetwarzanie, prezentacja Odtwarzanie treści multimedialnych Andrzej Majkowski informatyka +
Dr inż.Hieronim Piotr Janecki
Podstawy dynamiki płynów rzeczywistych Uderzenie hydrauliczne
Zapis prezentacji:

Kinetyka membran biologicznych - zmienność w stałości Piotr Targowski Kinetyka membran biologicznych - zmienność w stałości Kolokwium czwartkowe Instytut Fizyki UMK Toruń - 18 maja 2000

Kinetyka membran biologicznych - stałość w zmienności Piotr Targowski Kinetyka membran biologicznych - stałość w zmienności Kolokwium czwartkowe Instytut Fizyki UMK Toruń - 18 maja 2000

Schemat komórki [Encyklopedia multimedialna PWN - Biologia]

Membrana komórkowa ogranicza przestrzeń komórki umożliwia i kontroluje transport substancji odżywczych stanowi środowisko dla pewnych reakcji biochemicznych dostosowuje kształt komórki do wymogów tkanki

[ Z. Lengren - „Średniowieczne żarty”, RSW 1959 ]

[D. Voet, J.G. Voet, „Biochemistry”, J. Willey, 1980]

Plan wykładu Wstęp Obiekt badań Modele fluktuacji membrany model frakcyjny model dystrybucyjny Podsumowanie Aspekt krajoznawczy

WODA . . . . . . . H C O P N Model przestrzenny przekroju dwuwarstwowej błony fosfolipidowej [L. Stryer „Biochemia”, PWN, 1997 ]

50 nm Liposom - jednowarstwowy pęcherzyk fosfolipidowy, [D. Voet, J.G. Voet, „Biochemistry”, J. Willey, 1980]

Środowisko - małe liposomy DPPC DPH Ciśnienie (MPa) Temperatura (oC) T = 53 oC < r > < r > Koronen Ciśnienie (MPa) Temperatura (oC) Środowisko - małe liposomy DPPC

Koronen C24H12 Grupa punktowa symetrii D6h l (nm) 400 420 440 460 480 500 520 540 Fluorescencja (j. w.) 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0 Grupa punktowa symetrii D6h r0 = 0.1, jedna składowa zaniku r(t)

DPPC znakowane koronenem T=23 oC !?? 50 100 150 200 250 1000 2000 3000 4000 c 2 1 00 = . 1.0 0.5 czas (ns) vs fit-scatter Wsp. autokorelacji 0.0 VV-VH = r(t)·F(t) (zliczenia) -0.5 100 200 # kanału 3 Residua -3 Czas (ns) Czas zaniku fluorescencji DPH

Model frakcyjny

Model frakcyjny - podstawowe zależności Ponieważ fluorescencja sondy nie zależy od stanu środowiska, to albo Kinetyka procesów wymiany środowisk: szczegóły

Model frakcyjny - najważniejsze wyniki 5 10 15 20 25 30 35 40 1 2 3 4 5 10 15 20 25 30 35 40 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0 b F G N Rozmiary frakcji Temperatura (oC) Temperatura (oC) s

Wybrane stałe szybkości 5 10 15 20 25 30 35 40 Temperatura (oC) 1e+7 2e+7 3e+7 5e+8 1e+9 kFG kF Wybrane stałe szybkości s

Model frakcyjny - szczegóły rozwiązań Wynik eksperymentu może mieć postać zaniku o 3 składowych Przy założeniu można wyznaczyć parametry fizyczne

Własności zaniku fluorescencji koronenu w małych liposomach DPPC Temperatura (°C) 25 30 35 40 45 50 150 200 250 300 Czasy zaniku składowych t i (ns) 5 10 15 20 2 4 Wsp. wagowe składowych a i Temperatura (°C) 5 10 15 20 25 30 35 40 0.0 0.1 0.2 0.6 0.7 0.8 0.9 1.0 Własności zaniku fluorescencji koronenu w małych liposomach DPPC

Model frakcyjny F r a k c j a w y m i e n n a F r a k c j a s t a ł a G F F r a k c j a k w y m i e n n a F G F G F r a k c j a s t a ł a N C i e k ł y k r y s z t a ł Ż e l

Model dystrybucyjny . . . . S = 0 S > 0 F r a k c j w y m i e n G1 d(S1,T) G1 d(S2,T) G2 F F r a k c j w y m i e n d(S3,T) G3 . . . . d(Sn,T) Gn C i e k ł y r s z t a Ż l S = 0 S > 0

Model dystrybucyjny - podstawowe zależności

Model dystrybucyjny - najważniejsze wyniki Tt=39 oC Tt=39 oC o C ) 5 10 15 20 25 30 35 40 5.0e+7 1.0e+8 1.5e+8 5 10 15 20 25 30 35 40 50 100 3 d¥ (s-1) g Temperatura (oC) Temperatura (oC) Efekty ciśnieniowe s

Zespół zaangażowany w badania prof. dr Lesley Davenport dr Piotr Targowski (dr) Salvatore H. Atzeni (dr) Bo Shen dr Jay R. Kuntson (NIH) dr Michel Straher prof. dr hab. Andrzej Kowalczyk

Model dystrybucyjny, pomiary ciśnieniowe Temperatura Temperatura ekwiwalentna ( o C) 5 10 15 20 25 30 35 40 d ¥ (s -1 ) 5e+6 2e+7 5e+7 2e+8 5e+8 1e+7 1e+8 Temperatura Temperatura ekwiwalentna ( o C) 5 10 15 20 25 30 35 40 g 3 7 50 70 100 p= 0.1 MPa T=45.6 o C T=53.3 T=35.6

Równoważność ciśnienia i temperatury w membranach fosfolipidowych Ciśnienie hydrostatyczne (Mpa) 50 100 150 < r > (DPH) 0.0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.00 0.02 0.04 0.06 0.08 P 1/2 Temperatura ekwiwalentna T eq ( o C ) -30 -20 -10 10 20 30 40 50 60 Anizotropia emisji <r> 0.00 0.02 0.04 0.06 0.08 0.10 < r > (koronen) Temperatura ( o C ) 25 30 35 40 45 50 55 Ciśnienie P 1/2 (MPa) 20 60 80 100

Podsumowanie Membrana fosfolipidowa, poniżej temperatury przejścia fazowego, podlega powolnym fluktuacjom stanu uporządkowania, czasowo przechodząc do stanu ciekłego. Fluktuacje uporządkowania można opisać w oparciu o model frakcyjny albo dystrybucyjny. Jak dotąd eksperyment nie rozstrzyga, który model jest bliższy sytuacji fizycznej - prawdopodobnie należy poszukiwać ich pewnej kombinacji.

Energia swobodna F(S,T) F(S,T) (kJ/mol) Temperatura (oC) Parametr uporządkowania S

Gęstość prawdopodobieństwa P(S,T) Temperatura (oC) Parametr uporządkowania S