TOLL-LIKE RECEPTORS CD.
Członkowie rodziny (receptory): Drosophila Toll drosomycin (peptyd owady w wypadku infekcji syntetyzują przeciwgrzybiczne i antybakteryjne peptydy (wydzielają je do hemolimfy) ekspresja genów kodujących te peptydy – Toll family wysyła sygnał Członkowie rodziny (receptory): Drosophila Toll drosomycin (peptyd przeciwgrzybiczny) attacin , cecropin („antybakteryjne” geny) 18W Toll family = transbłonowe białka zawierające: na zewnątrz komórki leucine-rich repeat (LRR) [różna liczba powtórzeń , każde po 24-29 aa długości zawierające motyw xxLxLxx, odpowiadają za rozpoznanie patogenu] w warstwie cytoplazmatycznej domenę Toll/IL-1R (TIR) [~200 aa]
Na następnym slajdzie porównano Drosophila Toll i ssaczy Toll-like receptor z IL-1R (dwa w jednym) Legenda: linia ciągła duże podobieństwo struktur linia przerywana - - - - - - - - - - mniejsze mają pewien procent identyczności, ale niekoniecznie są homologami...(MyD88 z domeną TIR)
ligand powstały dzięki aktywności proteaz serynowych białko adaptorowe kinaza SerThr interakcja domen TIR degradacja IL-1R associated kinase nuclear factor translokacja do jądra
znów TLRy i PAMPy (z TLR6) stymulator dla makrofagów, kom.dend. Stphylococcus aureus, Corynebacterium diphtheriae, Nocardia coeliaca (z TLR6) stymulator dla makrofagów, kom.dend. endogenny ligand fragment (przy zranieniu) zależy od MyD88 = przynależność do TLR gdzie: LPS = lipopolisacharyd, HSP = heat shock protein, CpG = niezmetylowana cytydynofosfatoguanozyna (motyw)
Teraz będzie o LPS
LPS Gram(-) aktywacja makrofagów do produkcji prozapalnych cytokin, TNF-α, IL12, NO wiązany przez TLR4 wiązany przez LBP [LPS-binding protein] + CD14 (na zewnątrz komórki, zakotwiczone przez GPI→ ko-receptor), lub TLR2, ale badania dowiodły, że wówczas sygnał jest niewystarczający do prawidłowej odpowiedzi na patogeny) ↑ekspresję CD40, CD80, CD86 na powierzchni kom. dendrytycznych
IL-1R / TLR - sygnalizacja paski = LRR domeny Ig-podobne dwie niezależne od MyD88 drogi (też ma tak TLR3) gdy zablokowana... myeloid differentiation factor 88 ...opóźniona odpowiedź tędy TNF receptor associated factor nuclear factor Mitogen-Activated-Protein-Kinase
w kolorze MyD88 ma TIR i Death Domain (połączenie z Irak) DD-DD interaction
Jakie to ma znaczenie??? gdy MyD88 „zablokowany” to LPS : nie może sprowokować makrofagów do produkcji zapalnych cytokin, nie ma wybuchu limfocytów B nie powoduje szoku septycznego
folk.uio.no/karls/NF2001/Kaisho.pdf www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pubmed&pubmedid=12750407 http://www.sciencewatch.com/march-april2001/sw_march-april2001_page8.htm http://www.jbc.org/cgi/content/full/276/40/37692
http://www.nacos.com/jspp/pcp/pcp41-01.html#5 Zielona alga Pedastrum boryanum akumuluje plastocyjaninę w obecności Cu, a gdy miedź nie jest dostępna – cytochrom c6
Niektóre gatunki alg i cyjanobakterii są w stanie produkować plastocyjaninę (przenosi e między cytochromem b6/f a komplexem P700) i cytochrom c6 równocześnie (gdy jest Cu) W razie czego cytochrom c6 przejmuje funkcje plastocyjnaniny
→ plastocyjanina nie była więc produkowana PRE-APOPLASTOCYJANINA (kodowana przez pojedynczy gen) Σ 151 aa w białku 53 z tego powstaje 53 plastocyjanina zaobserwowano na mRNA 2 kodony: pierwszy kodon AUG występuje w CACAAUGGC (~sekwencja najwyższej zgodności u roślin niższych, inicjacja translacji), następny znajduje się 12 pozycji w stronę 3` możliwość podwójnej inicjacji translacji (?) komórki pozbawione miedzi akumulowały o 100 nukleotydów krótszą przy końcu 5` formę mRNA dla pre-apoplastocyjaniany, która nie podlegała translacji → plastocyjanina nie była więc produkowana
Co ciekawsze, gdy pojawiła się miedź, po godzinie alga syntetyzowała prawidłowe mRNA. Cu reguluje syntezę plastocyjaniny na 2 drogach: 1 - na poziomie mRNA 2 – też na poziomie gromadzenia białka Hipotezy, czemu mRNA ma różną długość: 1 – gen występuje w 2 kopiach i powstaje różny transkrypt w zależności od Cu (obalone) 2 – różne dojrzewanie mRNA/ post-transkrypcyjne modyfikacje (obalone) 3 – start transkrypcji jest zmodyfikowany przez GTAC (31-34) – CuRE (Copper-responsive element) 4 – zostaje wraz z rejonem 5` usunięta sekwencja cis-regulatorowa (u drożdży jest coś podobnego z Fe)
This phenomenon represents a novel regulatory mechanism, although details of the mechanism are not yet known. ???