POLITECHNIKA ŚLĄSKA WYDZIAŁ CHEMICZNY

Slides:



Advertisements
Podobne prezentacje
Chemioterapia Wytyczne i zasady stosowania
Advertisements

Polimorfizmy genu TNF- u chorych na reumatoidalne zapalenie stawów
Regulacja aktywności enzymów
GENETYKA BLIŹNIĄT JEDNOJAJOWYCH
Regulacja ekspresji transgenu w roślinach
Polimerazy RNA zależne od RNA, wirusy i wyciszanie RNA
Skojarzone leczenie nowotworów
Podstawy radioterapii nowotworów
RNA i transkrypcja u eukariontów
Etap 9: Określenie przydatności do oceny narażenia na promieniowanie jonizujące zmian transkryptomu w komórkach krwi obwodowej Dr Kamil Brzóska Centrum.
FLUOREK JAKO CZYNNIK PROZAPALNY I OGRANICZAJĄCY BIODOSTĘPNOŚĆ ATP W KOMÓRKACH MAKROFAGÓW Krzysztof Woźniak Studenckie Koło Naukowe przy Samodzielnej Pracowni.
Przygotowała: Marzena Józefiak
Kwasy nukleinowe jako leki
Kwasy nukleinowe jako leki
Wpływ rodzaju i stężenia soli nieorganicznych na mieszalność [bmim][BF 4 ]. Uniwersytet Warszawski Wydział Chemii Praca wykonana w Pracowni Radiochemii.
BADANIE DZIAŁANIA IZOTIOCYJANIANÓW NA KOMÓRKI LUDZKIE
Lisa M. Mehlmann Yoshinaga Saeki, Shigeru Tanaka, Thomas J
„Oocyte-specific expression of Gpr3 is required for maintenance of meiotic arrest in mouse oocytes.” Lisa M.Mehlmann „Ekspresja Gpr3 w oocycie jest wymagana.
Dla ludzkiego organizmu niezbędny jest tlen z powietrza,
PALENIE - ZŁY NAWYK SZKODZĄCY ZDROWIU
Uniwersytet Warszawski
Uniwersytet Warszawski
Uniwersytet Warszawski
PROAPOPTOTYCZNA TERAPIA GENOWA NOWOTWORÓW
Rola ekspresji SOX18 w komórkach nowotworowych oraz naczyniach w progresji raka przewodowego gruczołu piersiowego Bartosz Puła, Mateusz Olbromski1,2, Andrzej.
Analiza sieci genowych Agnieszka Marmołowska Jacek Ławrynowicz.
WPŁYW PALENIA NA NARZĄDY CZŁOWIEKA
The functional organization of mitochondrial genomes in human cells
Cukrzyca Grupa chorób charakteryzująca się hiperglikemią (podwyższonym poziomem cukru we krwi) wynikającą z defektu produkcji lub działania insuliny wydzielanej.
Akademia Młodych Biologów Lykeion Opieka merytoryczna PRACOWNIA BIOLOGII I CENTRUM EDUKACJI EKOLOGICZNEJ PAŁACU MŁODZIEŻY W KATOWICACH.
Regulacja acetylacji histonu H4, podczas dojrzewania mejotycznego, w oocytach myszy
Podsumowanie – wykład 4 Metoda amplifikacji 3’i 5’ końców cDNA (RACE PCR) Wektory plazmidowe do klonowania – test selekscyjny białych i niebieskich kolonii.
Konwersatorium Dr Marcin Piechota Dr Michał Korostyński Instytut Farmakologii PAN Statystyka w medycynie.
ENZYMY.
Diagnostyka laboratoryjna nowotworów
Wady rozwojowe.
Biotechnologia.
Funkcjonalne współzależności szlaków sygnałowych zależnych od czynników transkrypcyjnych TP53 i NFkB. Katarzyna Szołtysek.
Metabolizm aerobowy = produkcja wolnych rodników
wpływ promieniowania na przebieg szlaku NFkB
CZYNNIKI RYZYKA Spożywanie pokarmów bogatych w tłuszcze nasycone i siedzący tryb życia doprowadziły do wzrostu ryzyka rozwoju chorób układu sercowo-naczyniowego,
POLIMERAZY RNA Biorą udział w syntezie RNA na matrycy DNA- transkrypcji Początek i koniec transkrypcji regulują sekwencje DNA i wiążące się do nich białka.
Treści multimedialne - kodowanie, przetwarzanie, prezentacja Odtwarzanie treści multimedialnych Andrzej Majkowski informatyka +
Regulacja ekspresji genu
Interferencja RNA (RNAi, RNA interference)
OLIGONUKLEOTYDY ANTYSENSOWNE (ASO)
Tworzenie konstruktów ekspresyjnych siRNA. Metody wprowadzania siRNA siRNA Vector [DNA]
Badania PET-CT Wzrost metabolizmu FDG
Znaczenie końca 3’ mRNA w regulacji translacji – rola białka CPEB
LOGO Identyfikacja genów zależnych od czynnika transkrypcyjnego NFκB, na których ekspresję ma wpływ czynnik transkrypcyjny HSF1 Patryk Janus.
PROBLEMY ONKOLOGICZNE W GERIATRII
Obraz epidemiologiczny i kliniczny czerniaka złośliwego regionu głowy i szyi Artur Klimas.
ONKOLOGIA BIOLOGIA CHOROBY NOWOTWOROWEJ
Witaminy Jakub Dorobisz.
Strategie klonowania DNA
1 Zakład Mikrobiologii Stosowanej, Instytut Mikrobiologii, Wydział Biologii, Uniwersytet Warszawski, Warszawa 2 Zakład Mykologii, Katedra Mikrobiologii,
Czynniki ryzyka związane ze zdrowiem i chorobami
Estrogeny a nowotwory piersi u kobiet
2.22. Procesy i zasady kodowania informacji genetycznej
ONKOLOGIA BIOLOGIA CHOROBY NOWOTWOROWEJ
Biologia molekularna – dziedzina biologii zajmująca się badaniem struktury i funkcji makromolekuł, przede wszystkim białek i kwasów nukleinowych Makromolekuła.
Związek między polimorfizmem C/T genu osteopontyny i przyrostem masy ciała młodego bydła rasy polskiej holsztyńsko - fryzyjskiej Czarnik Urszula, Pareek.
Podział hormonów 1. Budowa strukturalna Peptydy i białka
Dr Anna Augustynowicz, Dr Aleksandra Czerw
u krwiodawców na Dolnym Śląsku”
Wstęp Wyniki Cel Wnioski
Ewelina Piasna-Słupecka:
WITAMINA C Julia Terlecka 1a.
Kwas askorbinowy .
Zapis prezentacji:

POLITECHNIKA ŚLĄSKA WYDZIAŁ CHEMICZNY KATEDRA CHEMII ORGANICZNEJ, BIOORGANICZNEJ I BIOTECHNOLOGII Wpływ hipoksji na ekspresję genu HSPA2 w keratynocytach NHEK i HaCaT oraz komórkach raka płaskonabłonkowego Anna HABRYKA Promotor: prof. Zdzisław KRAWCZYK Promotor pomocniczy: dr Dorota ŚCIEGLIŃSKA

HSPA2 Gen należący do rodziny HSPA. Ulega ekspresji w komórkach nowotworowych (m.in. A549, NCIH1299, MCF7, HeLa) oraz guzach pierwotnych płuc, szyjki macicy i pęcherza moczowego (Rohde i wsp., 2005; Ścieglińska i wsp., 2008; Garg i wsp.2010; Ścieglińska i wsp., 2014). Ulega ekspresji w licznych narządach i tkankach somatycznych człowieka, przy czym ekspresja ograniczona jest do specyficznych populacji komórek (Ścieglińska i wsp., 2011). Ścieglińska i wsp., 2011

Hipoksja Obniżenie stężenia tlenu poniżej wartości fizjologicznej. Występuje często w guzach litych i jest związana z nieprawidłowościami w budowie naczyń krwionośnych i/lub ich niedostateczną gęstością (Vaupe i Harrison, 2004; Wouters i wsp., 2007; Rofstad i wsp., 2007; Brahimi-Horn i wsp., 2007). W guzach litych wiąże się ze zmniejszoną wrażliwością komórek na działanie czynników terapeutycznych takich jak radioterapia czy chemioterapia (Brahimi-Horn i wsp., 2007; Wilson i Hay, 2011). B16(F10) De Vita JR i wsp., 2001 Olbryt i wsp., 2006

Czynnik transkrypcyjny HIF-1 Heterodimer zbudowany z podjednostek: α (zależnej od stężenia tlenu w komórce) oraz β (ulegającej konstytutywnej ekspresji). Regulacja stabilności podjednostki HIF-1 α zachodzi na drodze regulacji przez hydroksylazy proliny (PHD) oraz hydroksylazę asparaginy (FIH). Wiąże się do sekwencji (A/G)CGTG zwanej Hypoxia Responsive Element (HRE).

Hipoksja i HIF-1 w skórze Rola HIF-1 w skórze FIZJOLOGICZNA Prawidłowe różnicowanie keratynocytów (Weir i wsp., 2009) Ochrona przed infekcjami (Werth i wsp., 2010) Gojenie się ran (Fitsialos i wsp., 2008; Rezvani i wsp., 2011) PATOLOGICZNA Defekty w różnicowaniu naskórka (Takagi i wsp., 2003, Geng i wsp., 2006) Łuszczyca (Rosenberger i wsp., 2007) Chroniczne rany (Mace i wsp., 2007; Botusan i wsp., 2008) Transformacja melanocytów (Bedogni i wsp., 2005) Powstawanie niemelanocytarnych nowotworów skóry (Lining i wsp., 2009; An i wsp., 2014) za Nys i wsp., 2011, zmodyfikowane HIF1 Revzani i wsp., 2011

Główny model badawczy : Ekspresja HSPA2 i HIF1 w keratynocytach warstwy bazalnej naskórka Analiza in silico promotora HSPA2 HIF1 Revzani i wsp., 2011 Główny model badawczy : immortalizowane keratynocyty HaCaT

Główny cel pracy doktorskiej Wyjaśnienie czy w keratynocytach aktywność genu HSPA2 może być modulowana poprzez oddziaływanie czynnika transkrypcyjnego HIF-1 z sekwencją HRE.

Hipoksja – 1% O2 Stabilizacja białka HIF-1α Poziom transkryptów genów markerowych: CAIX, GLUT1, NDRG1 Poziom transkryptów HSPA2 Poziom białka HSPA2 Oddziaływanie HIF-1 z HRE –> ChIP-qPCR Analiza funkcjonalna promotora -> Dual Lucyferase Reporter Assay System (Promega)

Hipoksja powoduje obniżenie ekspresji HSPA2 w keratynocytach HaCaT qRT-PCR Względny poziom mRNA HSPA2 Taki sam wynik uzyskano dla pierwotnych keratynocytów NHEK oraz komórek raka płaskonabłonkowego A431.

HIF-1α wiąże się do sekwencji HRE w promotorze genu HSPA2 Lokalizacja starterów ChIP-qPCR k – kontrola h3 – hipoksja 3h h3e – hipoksja 3h + echinomycyna 160 nM h6 – hipoksja 6h h6e – hipoksja 6h + echinomycyna 160 nM

Aktywność promotora HSPA2 spada w warunkach hipoksji Plazmid zawierający fragment sekwencji promotora genu VEGF połączony z genem kodującym lucyferazę. Względny poziom aktywności Plazmid pHRE-luc został podarowany przez prof. Józefa Dulaka z UJ oraz dr H. Kimure z Southwestern Medical Center w Dallas (USA)

Stabilizacja HIF-1α w warunkach standardowych Deferoksamina (DFO) Chlorek kobaltu (CoCl2) Nadekspresja stabilnej formy białka HIF-1α

Deferoksamina i chlorek kobaltu powodują stabilizację HIF-1α w warunkach standardowych Względny poziom aktywności NDRG1 NDRG1

Hipoksja ≠ Hipoksja chemiczna Deferoksamina Chlorek kobaltu Względny poziom aktywności Wzrost aktywacji promotora HSPA2 niezależny od HRE Chlorek kobaltu powoduje powstawanie wolnych rodników Hipoksja ≠ Hipoksja chemiczna

Nadekspresja stabilnej formy białka HIF-1α w warunkach standardowych prowadzi do obniżenia poziomu transkryptów HSPA2 Wektory do nadekspresji podarowane przez prof. Lorenza Poellingera z Instytutu Karolińska w Sztokholmie. Wektor kontrolny (kodujący białko zielonej fluorescencji) podarowany przez dr Agnieszkę Łobodę i prof. Józefa Dulaka z Uniwersytetu Jagiellońskiego w Krakowie.

Inhibicja HIF-1 w warunkach hipoksji N-acetylocysteina (NAC) – destabilizacja białka HIF-1 Echinomycyna – hamowanie oddziaływania HIF-1 z DNA Wyciszenie HIF-1α metodą RNAi

Obniżenie poziomu HIF-1α przez N-acetylocysteinę (NAC) zwiększa aktywność promotora HSPA2

Zahamowanie oddziaływań HIF-1 z DNA przez echinomycynę powoduje wzrost ekspresji HSPA2 Analiza funkcjonalna promotora genu HSPA2 Chipa na poczatek Western blot PCR K – kontrola H – Hipoksja He1 – Hipoksja + Echinomycyna 80 nM He2 – Hipoksja + Echinomycyna 160 nM

Wyciszenie HIF-1α w warunkach hipoksji prowadzi do wzrostu ekspresji HSPA2 Względny poziom mRNA HIF-1α Względny poziom mRNA HSPA2 Scr H / shC H / shD H Scr / Scr H / shC H / shD H Zmienic wykresy na słupki Scr – wstawka kontrolna Scrambled shC – wstawka C wyciszająca HIF-1α shD – wstawka D wyciszająca HIF-1α H – hipoksja 24h

HepG2 MCF-7 HeLa Pierwsza strona, linie i ze rośnie

HIF-1 aktywuje ekspresję HSPA2 w komórkach HeLa Analiza funkcjonalna promotora genu HSPA2 Nadekspresja HIF-1α Hipoksja - 24 godziny

Reoksygenacja 1% O2 hipoksja 24h 21% O2 warunki standardowe 4h lub 8h Stres oksydacyjny

Ekspresja HSPA2 wzrasta w warunkach reoksygenacji Funkcjonalna analiza promotora Poziom mRNA

WNIOSKI: W keratynocytach HIF-1 działa jako negatywny regulator ekspresji genu HSPA2. Udział czynnika transkrypcyjnego HIF-1 w regulacji ekspresji genu HSPA2 może by zróżnicowany i zależeć od typu komórek. Ekspresja genu HSPA2 może by pobudzana w warunkach stresu oksydacyjnego.

Centrum Badań Translacyjnych i Biologii Molekularnej Nowotworów Badania finansowane z grantów: Ministerstwa Nauki i Szkolnictwa Wyższego N401 683740 oraz Narodowego Centrum Nauki N/NZ1/05/2012/00022 Centrum Badań Translacyjnych i Biologii Molekularnej Nowotworów dr Dorota Ścieglińska dr Agnieszka Gogler-Pigłowska prof. Zdzisław Krawczyk mgr Damian Sojka mgr Katarzyna Klarzyńska Krystyna Klyszcz Klinika Chirurgii Onkologicznej dr Mariusz Kryj

Dziękuję za uwagę