Krajowa Sieć Informacji o Bioróżnorodności www.ksib.edu.pl www.ksib.edu.pl Piotr Tykarski Uniwersytet Warszawski, Węzeł Główny KSIB.

Prezentacja na temat: "Krajowa Sieć Informacji o Bioróżnorodności www.ksib.edu.pl www.ksib.edu.pl Piotr Tykarski Uniwersytet Warszawski, Węzeł Główny KSIB."— Zapis prezentacji:

1 Krajowa Sieć Informacji o Bioróżnorodności www.ksib.edu.pl www.ksib.edu.pl Piotr Tykarski Uniwersytet Warszawski, Węzeł Główny KSIB

2 Historia Marzec 2001Marzec 2001 Podpisanie przez rząd RP Memorandum of Understanding : Polska staje się członkiem sieci 20032003 Środki finansowe z KBN na infrastrukturę (główny serwer) Decyzja w sprawie finansowania sieci Styczeń 2004Styczeń 2004 Powstanie Sieci Krajowej GBIF

3 Global Biodiversity Information Facility GLOBAL BIODIVERSITY INFORMATION FACILITY WWW.GBIF.ORG The GBIF Information System Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF

4 Global Biodiversity Information Facility GBIF objective l GBIF is an international scientific co-operative project based on a multilateral agreement (MoU) between countries, economies and international organisations, dedicated to: l establishing an distributed information infrastructure containing primary biodiversity data, l with initial focus on species- and specimen-level data, l with links to molecular, genetic and ecosystems levels l in order to make the worlds scientific biodiversity information freely and universally available to all Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF

5 Global Biodiversity Information Facility PARTICIPATION l Australia Feb 2001 l Belgium Feb 2001 l Canada Mar 2001 l Costa Rica May 2001 l Denmark Jan 2001 l Estonia Sep 2003 l Finland Apr 2001 l France Mar 2001 l Germany Feb 2001 l Iceland Jun 2001 l Japan Feb 2001 l Korea, Republic of May 2001 l Mexico Mar 2001 l Netherlands Feb 2001 l New Zealand Feb 2001 l Nicaragua Jun 2001 l Norway Mar 2004 l Peru Sep 2002 l Portugal Jun 2001 l Slovenia Feb 2001 l South Africa May 2003 l Spain Feb 2001 l Sweden Feb 2001 l United Kingdom Aug 2001 l United States of America Jan 2001 l Morocco Jun 2003 l Pakistan Aug 2001 l Papua New Guinea Mar 2004 l Poland Mar 2001 l Slovak Republic Aug 2001 l Switzerland Feb 2001 l Taiwan (Economy) Sep 2002 l Tanzania Sep 2002 l Argentina Mar 2002 l Austria Sep 2001 l Bulgaria Aug 2001 l Colombia Sep 2003 l Czech Republic Oct 2002 l Ghana Mar 2001 l India Aug 2003 l Indonesia Nov 2004 l Madagascar Jan 2003 Voting Participants Associate Participants: Countries Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF

6 Global Biodiversity Information Facility ASEAN Regional Centre for Biodiversity Conservation Dec 2003 ASEANET Oct 2002 All Species Foundation Mar 2002 BIOSIS Mar 2002 Botanic Gardens Conservation International Aug 2004 CABI Bioscience Sep 2001 EASIANET Oct 2002 European Commission Feb 2001 Expert Center for Taxonomic Identification Mar 2001 Finding Species Dec 2003 Species 2000 Mar 2001 Taxonomic Databases Working Group Mar 2002 UNESCO, Man and the Biosphere Programme May 2001 United Nations Environment Programme May 2001 Wildscreen Trust Jan 2003 World Federation for Culture Collections Oct 2002 Memorandum of Cooperation: Convention on Biological Diversity (CHM, GTI, GSPC, GISP) Catalogue of Life (ITIS, Sp2000) uBio? Freshwater Biological Association - FreshwaterLife Oct 2003 IUCN Sep 2003 Integrated Taxonomic Information System Mar 2001 International Centre for Insect Physiology and Ecology Mar 2004 Nordic Gene Bank Mar 2004 Ocean Biogeographic Information System Jun 2001 Pacific Biodiversity Information Forum Sep 2004 SAFRINET Aug 2003 Société de Bactériologie Systématique et Vétérinaire Dec 2002 Associate Participants: Organizations PARTICIPATION Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF

7 Global Biodiversity Information Facility GBIF as a global inte- grator Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF

8 Global Biodiversity Information Facility Data Providers Specimens: Flowering Plants of Africa Specimens: Proteaceae of the World Taxon Names: Proteaceae of the World Museum A Specimens: Mammals of North Europe Taxon Names: Mammals of the World Further Links: Mammals Museum C Specimens: Bacteria Cultures Taxon Names: Bacteria Further Links: Bacteria University D Observations: Birds of Central America Observations: Butterflies of Belize Observations: Erinaceus of Europe Observer Network B GBIF Data Providers install web services Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF GBIF Network

9 Global Biodiversity Information Facility GBIF deals with 1 biodiversity data Family: Pyralidae Order: Lepidoptera Class: Insecta Genus: Ostrinia Hübner, 1825 Vernacular (FR): Pyrale du maïs Vernacular (ES): Piral del maíz Vernacular (DE): Maiszünsler Vernacular (EN): European Corn-borer Collection:DGH Lepidoptera Record id:DGHEUR_003217 Country:France Coordinates:03.047˚E 48.730˚N Date:28 June 2003 Collector:Donald Hobern Specimen & Observation Data DIGIT + DADI Taxonomic Names ECAT + DADI Species: Ostrinia nubilalis (Hübner, 1796) Synonym: Pyralis nubilalis Hübner, 1796 o Foodplant: Zea mais L. 1753 Ecological Interactions Locus:AAL35331 Definition:acyl-CoA Z/E11 desaturase 1 mvpyattadg hpekdecfed... Sequence Data Average Rainfall Location: 48.82°N 2.29°E Jan Feb Mar Apr... 182.3 120.6 158.1 204.9... Abiotic Data Diagnosis: Wingspan 26-30mm; sexually dimorphic;male: forewings ochreous to dark brown; female: forewings pale yellow; … Taxonomic Descriptions Pheromones of Ostrinia http://www.nysaes.cornell.edu/fst/faculty/a cree/pheronet/phlist/ostrinia.html Digital Literature and Web Resources Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF

10 Global Biodiversity Information Facility Users and applications need data structured according to standards 2003-06-08 DGH DGH Lepidoptera DGHEUR_0002976 Dichomeris marginella (Fabricius, 1781) O Animalia Lepidoptera Gelechiidae Dichomeris marginella (Fabricius, 1781) Donald Hobern 2003 06 08 Europe Denmark Gentofte Amt Merianvej, Hellerup 12.538 55.737 100 1 1 in Skinner trap June 2003 S M T W T F S 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 Observation record formatted using the Darwin Core Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF

11 Global Biodiversity Information Facility Web services enable the aggregation of structured data HeterogeneousDatabases Web Services Standardised Structured Data User … … … Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF

12 Global Biodiversity Information Facility GBIF node responsibilities GBIF Registry, Index, and Portal Data Node Participant Node Portal 1.Network 2.Registry 3.Standards 4.Tools 1.Encourage participation 2.Manage registration of Data Nodes 1.Coordination 2.Network 3.Registry 4.Standards 5.Tools 6.Consolidated Data 1.Metadata 2.Data 1.Identify Data Nodes 2.Endorse and quality assure data nodes 3.National Language Interfaces Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIF

13 Zasady działania Sieci Krajowej Ścisła współpraca z siecią GBIFŚcisła współpraca z siecią GBIF Struktura otwartaStruktura otwarta Członkowie - 9 instytucjiCzłonkowie - 9 instytucji Koordynator Sieci Krajowej:Koordynator Sieci Krajowej: Wydział Biologii UW - Węzeł Krajowy GBIF Węzły Danych - 6 aktywnychWęzły Danych - 6 aktywnych –ok. 68000 rekordów Typy danych:Typy danych: –I: rozmieszczenie gatunków (wystąpienie w przestrzeni i w czasie: okaz/obserwacja) –II: dane z kolekcji szczepów, kultur, banków nasion etc.

14 Uczestnicy Sieci okazyobserwacjemikrobiol. Instytut Biochemii i Biofizyki x Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin x Instytut Nauk o Środowisku UJ x Instytut Ochrony Przyrody PAN x Instytut Zoologii UJ xx Muzeum i Instytut Zoologii PAN xx Ogród Botaniczny UW x Wydział Biologii UW xxx Zakład Badania Ssaków PAN xx

15 Plany rozwoju Sieci Zwiększenie liczby rekordów (250000 w 2005 r.)Zwiększenie liczby rekordów (250000 w 2005 r.) Przyłączanie nowych uczestnikówPrzyłączanie nowych uczestników Digitalizacja informacji o bioróżnorodnościDigitalizacja informacji o bioróżnorodności Standaryzacja: ustalenie wspólnych standardów wymiany i organizacji danychStandaryzacja: ustalenie wspólnych standardów wymiany i organizacji danych Współpraca z innymi instytucjami i strukturami związanymi z tematyką bioróżnorodności w PolsceWspółpraca z innymi instytucjami i strukturami związanymi z tematyką bioróżnorodności w Polsce Utworzenie wewnętrznego systemu wymiany informacjiUtworzenie wewnętrznego systemu wymiany informacji

16 Zadania koordynatora Utworzenie i uzupełnianie rejestru instytucji posiadających wartościowe daneUtworzenie i uzupełnianie rejestru instytucji posiadających wartościowe dane Poszukiwanie potencjalnych uczestnikówPoszukiwanie potencjalnych uczestników Kontakt z siecią GBIFKontakt z siecią GBIF Koordynacja: bazy referencyjne dot. taksonomii i GIS dla uczestników SieciKoordynacja: bazy referencyjne dot. taksonomii i GIS dla uczestników Sieci Rozwijanie funkcji węzła danychRozwijanie funkcji węzła danych –możliwość udostępniania serwera na potrzeby innych członków sieci Szkolenia i wsparcie techniczne dla członkówSzkolenia i wsparcie techniczne dla członków Działania integracyjneDziałania integracyjne –wspólne projekty badawcze i aplikacyjne –utworzenie wewnętrznego systemu wymiany informacji dla członków Sieci Zdobywanie środków na działanie SieciZdobywanie środków na działanie Sieci –wniosek na lata 2005-2008

17 Dlaczego warto być w Sieci Możliwość prezentacji własnego dorobku w sieci światowejMożliwość prezentacji własnego dorobku w sieci światowej Dostęp do danych udostępnionych wewnątrz Sieci KrajowejDostęp do danych udostępnionych wewnątrz Sieci Krajowej Dostęp do nowoczesnych technologii zarządzania i wymiany informacjiDostęp do nowoczesnych technologii zarządzania i wymiany informacji Możliwość uczestniczenia w projektach naukowych opartych o dane udostępnione w Sieci KrajowejMożliwość uczestniczenia w projektach naukowych opartych o dane udostępnione w Sieci Krajowej