Wykorzystano materiały Tomasz Strabel, UP Poznań

Prezentacja na temat: "Wykorzystano materiały Tomasz Strabel, UP Poznań"— Zapis prezentacji:

1 Wykorzystano materiały Tomasz Strabel, UP Poznań
Selekcja genomowa 2016 Krzysztof Gałązka Wykorzystano materiały Tomasz Strabel, UP Poznań

2 Wyniki kontroli użytkowości Informacja rodowodowa Informacja o markerach WH konwencjonalna WH genomowa

3 Selekcja buhajów i samic
Metoda tradycyjna (dotychczasowa) wymagała 6 lat od kojarzenia pary rodzicielskiej do wyceny urodzonego buhaja na jego córkach! Dokładność oceny wh samic osiąga max. 45% Model tradycyjny jest dokładny ale kosztowny i trwający w czasie.

4 … POPRZEZ WYKORZYSTANIE MARKERÓW GENETYCZNYCH – SELEKCJA GENOMOWA
ZACZETO STAWIAĆ PYTANIA, W JAKI SPOSÓB: 1- OBNIŻYĆ KOSZTY WYCENY? 2- WCZESNIEJ UZYSKAĆ WYNIKI OCENY WH? 3- PRZYSPIESZYĆ POSTĘP? … POPRZEZ WYKORZYSTANIE MARKERÓW GENETYCZNYCH – SELEKCJA GENOMOWA

5 Selekcja genomowa MARKER GENETYCZNY, CO TO JEST?
Fragment DNA, który dziedziczy się w kolejnych pokoleniach. Marker pozwala przewidzieć genetyczną wartość cech użytkowych Wykorzystuje się techniki laboratoryjne oraz modele statystyczne do pozyskania wyników

6 Selekcja genomowa DNA znajduje się w chromosomach jąder komórkowych, zawiera informację genetyczną. Chromosomy zawierają genów Liczba poznanych fragmentów DNA (markerów genetycznych) ma wpływ na dokładność oceny Dotychczas poznano markerów Dziedzina poznawania kolejnych markerów jest bardzo rozwojowa

7 Selekcja genomowa Wyniki genomowania prezentowane są w postaci indeksu zgodnie z obowiązującą formułą Bezpośrednia genomowa wh jest niezależna od metody tradycyjnej Wiarygodność wyniku oceny jest wyższa dla cech wysoko odziedziczalnych (np. prod. mleka) oraz niższa dla nisko odziedziczalnych (np. płodność)

8 Wzbogacenie genomowe Wzbogacenie genomowe 50-100 córek >100 córek
Ocena tradycyjna Ocena genomowa córek >100 córek Indeks rodowodowy

9 Program selekcji buhajów na podstawie potomstwa
Wybór rodziców, kojarzenie 6 Indeks buhaja Urodzenie buhajka 9 15 Testowanie 3 9 Urodzenia córek 1 Inseminacja 24 Wycielenia córek 6 lat

10 Selekcja buhajów Ostrość selekcji (tradycyjna) ograniczona była przez liczbę testowanych buhajów Dokładność zależna jest w istotny sposób od współczynnika odziedziczalności Koszt oceny buhaja to kilkadziesiąt tysięcy EURO

11 Selekcja genomowa buhajów
Skrócenie odstępu między pokoleniami (decyzja przy pierwszym unasienianiu jałówki) Wzrost dokładności oceny i selekcji młodych samic (ale spadek dokładności oceny buhajów) Zwiększenie postępu genetycznego (2-krotnie) Obniżenie kosztów realizacji programów hodowlanych, związanych z wyczekiwaniem buhajów

12 Selekcja genomowa buhajów
Obniżenie tempa przyrostu inbredu; nowe linie genetyczne (…?) Wzrost znaczenia samic w programach hodowlanych (wyższa dokładność). Bardzo wczesna informacja m.in. o długowieczności. Dla cech nisko odziedziczalnych wymagana jest odpowiednio liczebna baza referencyjna.

13 Selekcja genomowa Selekcja genomowa polega na selekcjonowaniu buhajów i samic na podstawie ich wartości hodowlanej, obliczonej bezpośrednio w oparciu o markery genetyczne rozmieszczone na całym genomie tak zwane SNP- (polimorfizmy jedno nukleotydowe)

14 Selekcja genomowa buhajów
Wartość alleli markerów jest obliczana na podstawie populacji referencyjnej w oparciu o połączenie informacji genomowej z informacją fenotypową. Baza populacji referencyjnej - wyniki buhajów na podstawie potomstwa mających informację genomową.

15 Selekcja genomowa - równania predykcji
PA Znany fenotyp √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ Znany genotyp Równania predykcji GWH GWH GWH GWH GWH GWH GWH

16 Selekcja genomowa buhajów – Populacja referencyjna
Niski współczynnik spokrewnienia badanego osobnika z populacją referencyjną wpływa na obniżenie dokładności genomowej wh Stały wzrost liczebności bazy referencyjnej jest nieodzownym elementem ulepszania wyników genomowania

17 Selekcja genomowa buhajów- Roczny postęp genetyczny
W wyniku: - większej intensywności selekcji matek buhajów, - wyższej dokładności indeksów matek buhajów, - skróceniu odstępu międzypokoleniowego… …postęp genetyczny zwiększy się dla wszystkich cech - dwukrotnie.

18 Selekcja genomowa buhajów - wzrost znaczenia samic
W programach oceny i selekcji buhajów wzrasta ranga samic (MB), głównie z powodu wzrostu dokładności wartości hodowlanych . Drugim powodem jest wczesna informacja. Samice zostają odpowiednio kojarzone z buhajami już jako jałówki. Pojawia się szansa na wprowadzenie do hodowli nowych linii rodowodowych 

19 Genotypowanie a zarządzanie stadem
Poznanie wartości hodowlanych młodych samic pozwala na trafne decyzje selekcyjne w stadzie Znajomość ocen wh zarówno produkcyjnych, jak i funkcjonalnych na etapie jałówek zmniejszy koszty odchowu eliminując sztuki o zbyt niskich oczekiwanych parametrach. Już podczas pierwszego unasieniania, gdy znamy parametry hodowlane jałówki mamy realną możliwość precyzyjnego doboru buhaja o optymalnych wartościach hodowlanych.

20 Selekcja genomowa buhajów
-znaczenie owub Ocena wartości użytkowej bydła nadal będzie niezbędna, gdyż selekcja genomowa wymaga weryfikacji o informacje fenotypowe.

21 Selekcja genomowa buhajów -Postęp hodowlany
Rt – wielkość postępu hodowlanego w jednostce czasu i – ostrość selekcji p dokładność oceny (selekcji) бA – zmienność genetyczna L – odstęp pokoleń

22 Selekcja genomowa buhajów POLSKA
Program genotypowania od 2008 przez konsorcjum MASinBULL (SHiUZ Bydgoszcz, Uniwersytet Olsztyn i Wrocław IZ Balice) 2010 wyniki oceny genomowej kg białka uznał INTERBULL 2011 MCB Krasne przystępuje do konsorcjum 2012 SU Łowicz i Tulce włączają się do konsorcjum – zmiana „Genomika Polska”

23 Selekcja genomowa buhajów POLSKA
X.2012 Genomika Polska przystępuje do EuroGenomics XII.2012 walidacja pokroju w Interbbull VII.2013 walidacja produkcji, komórek somatycznych i płodności – pozytywna walidacja w Interbull.

24 Selekcja genomowa buhajów POLSKA
Ocena genomowa w Polsce uznana jest jako oficjalna i wdrożona od wyceny sierpniowej Dopuszczone jest nasienie buhajów genomicznych pochodzących z Europy i Ameryki

25 Selekcja genomowa POLSKA
PFHBiPM realizuje ocenę genomową jałowic i krów, na potrzeby zarządzania stadem oraz na potrzeby programów hodowlanych. Analiza genomowa wykonywana jest w Laboratorium Genetyki Bydła w Parzniewie.

26 Selekcja genomowa buhajów POLSKA
Krajowy program hodowlany dla rasy PHF został odpowiednio zaktualizowany w przez PFHBiPM. W dalszej konsekwencji Spółki Unasieniania w Polsce zmodyfikowały realizowane programy oceny i selekcji buhajów PHF

27 Selekcja genomowa buhajów POLSKA
SEZON LICZBA HODOWCÓW LICZBA SAMIC WARTOŚCI gPF 2015.1 68 HO – 1238 95-148 RW - 106 88-127 2015.2 82 HO -1109 92-144 RW - 91 79-127 2015.3 116 HO – 1135 91-159 RW - 113 92-123