Analiza komórek w cytofluorymetrii przepływowej przy pomocy narzędzi Data Mining serwera SQL 2008 R2 Marcin Szeliga Trener & Konsultant

Slides:



Advertisements
Podobne prezentacje
Badania statystyczne Wykłady 1-2 © Leszek Smolarek.
Advertisements

INSTRUKCJA KORZYSTANIA Z KATALOGU ON-LINE
Data Mining w e-commerce
Ocena dokładności pomiarów
K. Giannopoulos, P. Pożarowski, S. Radej, J. Roliński
„Migracja środowisk Microsoft NT/Active Directory/Exchange oraz SharePoint do nowych wersji przy użyciu narzędzi Quest Software” Grzegorz Szafrański Product.
Macierzyństwo kobiet leczonych wcześniej z powodu raka piersi
Bezpieczeństwo aplikacji WWW
"Szlachetne zdrowie, nikt się nie dowie, jako smakujesz,
Analiza ryzyka projektu
Jak mierzyć efektywność realizacji procesu
Dowody Naukowe - Przeczytamy i ufamy... nie zawsze
Zapanuj nad dokumentami
CLUSTERING Metody grupowania danych Plan wykładu Wprowadzenie Dziedziny zastosowania Co to jest problem klastrowania? Problem wyszukiwania optymalnych.
Budowa i funkcje elektronicznego katalogu biblioteki szkolnej
Powinien być określony w sposób zwięzły i precyzyjny, np
ISO 9001:2000 z perspektywy CMMI a poznańska rzeczywistość
Statystyka w doświadczalnictwie
Algorytmy generowania reguł decyzyjnych
Internet jako źródło informacji dla pacjenta na temat schorzeń i leków
Krzysztof Suchecki wybrana prezentacja z konferencji ECCS'07 w Dreźnie Interacting Random Boolean Networks.
Projekt i opracowanie :
Życiorys mgr inż. Seweryn Lipiński Katedra Elektrotechniki i Energetyki Wydział Nauk Technicznych Uniwersytet Warmińsko-Mazurski w Olsztynie Urodzony:
Elektroniczny Rekord Pacjenta = Elektroniczna Dokumentacja Medyczna
PRZYŁĄCZ SIĘ DO WALKI Z BIAŁACZKĄ!
MIEJSCA GDZIE SĄ PODEJMOWANE DECYZJE Z KIM ROZMAWIAŁEŚ? Z LEKARZEM, PRACOWNIKIEM TEGO ODDZIAŁU. Z LEKARZEM, PRACOWNIKIEM TEGO ODDZIAŁU.
Autorzy: mgr inż. Jerzy KOWALEWSKI, dr inż. Paweł SULIK
Budowa i ocena efektywności programu automatyzującego wybrane metody analizy technicznej walorów WGPW. Autor referatu: Andrzej Korpysz
Promotor: dr.inż. Aleksandra Werner
Hipotezy statystyczne
Skuteczność leczenia metodą FED u osób ze skoliozą w różnym wieku metrykalnym i kostnym w Ośrodku „BIO” Mariusz Czarnecki w Końskich. Mariusz Czarnecki,
Konstrukcja, estymacja parametrów
Anna Mueck grupa A/B, OAM
Oprac. - M. Rostkowska 1 Warsztaty Komputery w edukacji COMPUTERS IN EDUCATION.
Władcy Danych Wykorzystanie Master Data Services do zapanowania nad wszechobecnym chaosem Paweł Potasiński.
Materiał do badań : Uniwersytet Rzeszowski semestr 2005/ kierunki studiów : filologia polska, historia, matematyka - II i IV rok 143 studentów i.
Cytometria przepływowa
Zarządzanie danymi biznesowymi za pomocą usług EIM serwera SQL 2012, czyli jak SSIS, MDM i DQS rozwiązują problem błędnych danych Marcin Szeliga
Wyniki badania - Infolinia jako kanał komunikacji z klientem -
Dr hab. Dariusz Piwczyński Katedra Genetyki i Podstaw Hodowli Zwierząt
Techniki eksploracji danych
Google Testing Radosław Smilgin, , TestWarez.
Konsultant w ABC Data Centrum Edukacyjne Microsoft Certified Trainer od 2004 roku Microsoft Most Valuable Professional od 2008 roku Autor dwóch książek.
W POSZUKIWANIU LICZB PIERWSZYCH.
PACJENT Z POCHP W PRAKTYCE LEKARZA RODZINNEGO TERAPIA, MEDYCYNA RODZINNA 1/2008.
JAK SZUKAĆ W KATALOGU KOMPUTEROWYM?
Następna strona Czyli: gdzie, co, jak i dlaczego?
Analiza wyników sprawdzianu ‘2013
Kluczowe czynniki sukcesu
Dni Dawcy Szpik dla Olusia i Innych
STRATEGIE OCENIANIA KSZTAŁTUJACEGO
Badanie kwartalne BO 2.3 SPO RZL Wybrane wyniki porównawcze edycji I- VII Badanie kwartalne Beneficjentów Ostatecznych Działania 2.3 SPO RZL – schemat.
Komendy SQL do pracy z tabelami i bazami
PRZYŁĄCZ SIĘ DO WALKI Z BIAŁACZKĄ!
Zestawienie wyników statystycznych
Nowe zachorowania na zespół nerczycowy w populacji dzieci polskich na podstawie danych Nephrosis OnLine – doniesienie wstępne Dr n. med. Magdalena Drożyńska-Duklas.
Potencjalni dawcy szpiku kostnego- sytuacja w Polsce W Polsce co godzinę stawiana jest komuś diagnoza: nowotwór krwi, czyli białaczka - co roku słyszy.
Henryk Rusinowski, Marcin Plis
WYNIKI EGZAMINU MATURALNEGO W ZESPOLE SZKÓŁ TECHNICZNYCH
Co to jest dystrybuanta?
Kim jesteśmy? Jesteśmy siecią Centrów Dietetycznych, a naszą misją jest reedukacja żywieniowa. Rolą naszych dietetyków jest przede wszystkim przekazywanie.
Zalety randomizacji Eliminacja zaburzeń w ocenie efektu (bias)
Wnioskowanie statystyczne
Zachodniopomorski Oddział Wojewódzki 1 Personalne listy pacjentów oczekujących na wybrane świadczenia opieki zdrowotnej Angelika Milkiewicz-Ławicka Naczelnik.
ANKIETA ZOSTAŁA PRZEPROWADZONA WŚRÓD UCZNIÓW GIMNAZJUM ZPO W BORONOWIE.
Metody Matematyczne w Inżynierii Chemicznej Podstawy obliczeń statystycznych.
Kontrola stymulatorów jako skuteczna metoda zapobiegania udarom mózgu. Michał Chudzik
Autorzy pracy: Michał Lemański Michał Rozmarynowski I Liceum Ogólnokształcące im. Tadeusza Kościuszki w Wieluniu Pomiar przyspieszenia ziemskiego przy.
Wykrywanie zmian pokrycia terenu w oparciu o wieloczasowe dane satelitarne. Monika Banaś geodezja i kartografia dr inż. Tomasz Pirowski.
Selekcja danych Korelacja.
Zapis prezentacji:

Analiza komórek w cytofluorymetrii przepływowej przy pomocy narzędzi Data Mining serwera SQL 2008 R2 Marcin Szeliga Trener & Konsultant

MarcinSzeliga:Bio.ToPP() +15 lat doświadczenia z serwerem SQL Trener & konsultant Autor książek i artykułów SQL Microsoft Most Valuable Professional (od 2006) Microsoft Specialist (od 2000)

Cele Wykazanie przydatności automatycznej analizy danych z FCM Segmentacja danych z FCM pod kątem obecności nieprawidłowych subpopulacji komórek Automatyczna klasyfikacja znalezionych subpopulacji i ich opis statystyczny Wyszukiwanie komórek nie pasujących do klastrów komórek prawidłowych, z ich oceną ilościową i statystyczną co ma znaczenie w monitorowaniu leczenia i ocenie tzw. choroby resztkowej Ocena zmian subpopulacji komórek u tego samego pacjenta w trakcie leczenia

Szczegóły Dane źródłowe z 9-kanałowego cytofluorymetru o 18-bitowej dokładności: 17 pacjentów z białaczką ( komórek) 17 pacjentów w reemisji ( komórek) Oprócz pacjentów w remisji oraz z ostrą białaczką limfoblastyczną, dane źródłowe pochodziły również od pacjentów na różnym etapie leczenia u niektórych z nich procent komórek białaczkowych nie przekraczał 3%

Dane treningowe Eliminacja błędów FSCA < SSCA < Pierwsza segmentacja (FSCA, SSCA, CD19) Klastry CD19+ i CD19++ (Leukemia 67% Remission 36%) Około 80% Klastry CD19- Właściwa segmentacja (Wszystkie zmienne) Około 15% Bramkowanie

Właściwa segmentacja (Wszystkie zmienne) Klastry typowych komórek Klastry komórek aberrantnych Klastry komórek mieszanych Klasyfikacja Komórki aberrantne Wykres Komórki typowe

Dane pacjenta Eliminacja błędów FSCA < SSCA < Sprawdzenie przynależności do klastrów CD19+ lub CD % Komórki CD19- Wykrycie nietypowych komórek 1% Komórki nietypowe 30% Sprawdzenie przynależności do głównych klastrów Klasyfikacja

Sprawdzenie przynależności do głównych klastrów Klastry komórek białaczkowych Klastry komórek mieszanych Klastry typowych komórek Klasyfikacja Komórki typowe Komórki białaczkowe Klasyfikacja

Wnioski Szukanie klastrów tworzonych przez zdrowe komórki pozwoliło osiągnąć wyniki co najmniej tak samo dobre jak dotychczas stosowane metody ręcznego bramkowania Możliwość określenia prawdopodobieństwa przynależności danej komórki do znalezionych wcześniej klastrów Automatyczna klasyfikacja komórek jako zdrowych lub białaczkowych z ponad 80% dokładnością i prawie 100% wiarygodnością Możliwość określenie powodu i stopnia nietypowości komórek Możliwość oceny i identyfikacji zmian subpopulacji komórkowych w trakcie leczenia białaczki

Analiza komórek w cytofluorymetrii przepływowej przy pomocy narzędzi Data Mining serwera SQL 2008 R2 Marcin Szeliga Trener & Konsultant