Pobierz prezentację
Pobieranie prezentacji. Proszę czekać
1
Podstawy mikrobiologii środowiska
2
Związek ewolucyjny pomiędzy Archea, Bacteria i Eukarya
3
Różnice pomiędzy Archea, Bacteria i Eukarya
Cecha Archea Bacteria Eukarya Genom Błona jądrowa Histony Ilość DNA/komórkę Pozachromosomalne DNA Chloroplasty i mitochondria DNA w organellach Rybosomy Rybosomy w organellach Inicjatorowy tRNA Błona cytoplazmatyczna Ściana komórkowa Tworzenie spor Pojedynczy, kolisty Brak 5 g Obecne 70 S, wrażliwe na toksynę dyfterytu Met Glicerol/izopren Polisacharydy Nie 70 S, oporne na toksynę dyfterytu N-formylo-Met Fosfolipidy Peptydoglikan Tak, u niektórych Liniowe chromosomy, >1 Obecna 0,5 - 3 g 80 S, wrażliwe na toksynę dyfterytu 70 S Fosfolipidy/sterole
4
Elementy struktury komórki bakteryjnej, roślinnej i zwierzęcej
5
Bakterie – rodzaje ściany komórkowej
6
Megabakteria Bakteria Epulopiscium fishelsoni jest największą znaną bakterią. Komórka tego drobnoustroju, będącego składnikiem flory bakteryjnej ryb żyjących w Morzu Czerwonym, ma długość dochodzącą do 0.6 mm.
8
Glony (algi) Mikroalgi Makroalgi (wodorosty) Chlorella
Haematococcus pluviatus Makroalgi (wodorosty)
9
Zygomycetes – grzyby pleśniowe, sprzężniaki
Grzybnia zbudowana z niepodzielnego mycelium. Rozmnażanie płciowe poprzez zarodniki zwane zygosporami lub bezpłciowe poprzez spory w sporangium. Ascomycetes – workowce Grzyby jednokomórkowe lub tworzące grzybnię w postaci podzielnych strzępek. Rozmnażanie płciowe poprzez askospory lub bezpłciowe przez konidia. Do tej klasy należą m.in. Neurospra, Penicillium. Mucor racemous Aspergillus fumigatus Penicillium chrysogenum
10
Basidomycetes – podstawczaki
Grzyby jednokomórkowe lub rozgałęzione. Rozmnażanie płciowe poprzez basidospory lub bezpłciowe poprzez konidia. Do tej klasy należą grzyby kapeluszowe. Deuteromycetes – grzyby niedoskonałe Cecha charakterystyczna – brak rozmnażania płciowego. Amanita phalloides Candida albicans
11
Morfologia wzrostu grzyba na podłożu utwardzonym
12
Sposoby wzrostu komórek drobnoustrojów
13
Pierwotniaki Na poziomie komórkowym dość bliskie zwierzętom;
Jednokomórkowce niefotosyntetyzujące; Brak ściany komórkowej; Rozmnażanie wegetatywne (podział) lub seksualne poprzez połączenie haploidalnych gamet; Główne znaczenie: czynnik etiologiczny chorób infekcyjnych po spożyciu wody oraz w aerobowym oczyszczaniu ścieków Paramecium
14
Metody pomiaru ilości biomasy lub liczby komórek
Określenie wilgotnej lub suchej masy Określenie objętości upakowanej biomasy Pomiar gęstości optycznej zawiesiny komórek Cytometria przepływowa Hemocytometria Licznik Coultera Określenie CFU metodą posiewową lub poprzez wybarwienier
15
Komora do pomiaru liczby komórek drobnoustrojów
16
Schemat licznika Coultera
17
Schemat cytometru przepływowego
18
Określanie liczby żywych komórek (CFU)
19
Metody analizy in situ populacji drobnoustrojów
Mikroskopia elektronowa i konfokalna (CLSM) Testy ELISA Analiza lipidów (PLFA) Analiza rRNA Technologia PCR In situ hybrydyzacja
20
Mikroskopia konfokalna
Optyczne cięcie sfery przez płaszczyzny konfokalne Obraz CSLM matrycy kolagenowej z rosnącymi fibroblastami wybarwionymi fluorescencyjnymi przeciwciałami rozpoznającymi tubulinę W technice CSLM próbka naświetlana jest spolaryzowanym promieniem lasera podawanym pod różnymi kątami. Emitowana fluorescencja jest poddawana „filtracji” w szczelinie dla wyeliminowania promieniowania pochodzącego z innych płaszczyzn. W efekcie otrzymuje się serię obrazów dla kilkudziesięciu płaszczyzn, których suma daje praktycznie trójwymiarowy obraz próbki. Zasada działania konfokalnego mikroskopu skanującego
21
Testy ELISA Zasada: Otrzymuje się przeciwciała rozpoznające
antygeny obecne w ścianach komórkowych drobnoustrojów. Konstruuje się koniugaty przeciwciał z markerami fluorescencyjnymi Koniugaty immobilizuje się w studzienkach mikropłytek Do studzienek dodaje się próbki Odmywa się komórki niezwiązane Mierzy się intensywność afektu optycznego, który jest miarą ilości komórek danego gatunku obecnych w próbce
22
Analiza lipidów (PLFA)
Ekstrakcja składników lipidowych z próbek środowiskowych
23
Analiza rRNA Ekstrakcja kwasów nukleinowych z próbek środowiskowych w celu izolacji i identyfikacji sekwencji rRNA
24
In situ hybrydyzacja Obraz populacji drobnoustrojów w biofilmie uzyskany w wyniku zastosowania techniki FISH
25
Pośrednie metody pomiary tempa wzrostu
26
Warunki wzrostu bakterii umiarkowanie i silnie halofilnych
27
Podział drobnoustrojów w zależności od optymalnych
temperatur wzrostu
28
Wpływ obecności tlenu na wzrost różnych
grup drobnoustrojów
29
Fazy wzrostu drobnoustrojów
30
Struktura biofilmu
31
Tworzenie endosporu i kiełkowanie sporu
Podobne prezentacje
© 2024 SlidePlayer.pl Inc.
All rights reserved.