PODSUMOWANIE METOD KINETYCZNYCH

Prezentacja na temat: "PODSUMOWANIE METOD KINETYCZNYCH"— Zapis prezentacji:

1 PODSUMOWANIE METOD KINETYCZNYCH
Kuba Skrzeczkowski Zajęcia 50

2 PRZED NAMI… Przybliżenie stanu stacjonarnego (steady-state approximation) Metoda szybkości początkowych (initial rates method) Metoda pozornych stałych szybkości (apparent rate constants method).

3 MECHANIZM MICHAELISA - MENTEN

4 JAK DZIAŁA ENZYM? Lock and key model. Pobrane z:

5 KARBOKSYPEPTYDAZA To przykład enzymu: Widać tu miejsce aktywne enzymu: Zwróć uwagę na kształt enzymu… Źródło:

6 Gdyby jej nie było to nasz brzuch wyglądałby tak:

7 Ponieważ jest to wygląda to tak: 

8 Ewentualnie jak ktoś je za dużo:

9 Więc … Karboksypeptydaza pełni rolę maszynki do przetwarzania aminokwasów! Rozwala peptydy, które wchodzą do organizmu na aminokwasy. Z tych aminokwasów budujemy peptydy, których potrzebujemy.

10 Ogólne działanie

11 Mechanizm Michaelisa - Menten
Ćwiczenie. Wyprowadź równanie na szybkość tworzenia produktu w reakcji katalizowanej enzymem?

12 Wyprowadzone równanie…
Powinno mieć postać: Ale w tym równaniu mamy [E], którego możemy nie znać. Tymczasem znamy [E]0 które znamy (bo przecież wiemy ile wprowadzaliśmy). Jak zmodyfikować równanie?

13 ROZWIĄZANIE Odpowiedź: Na etapie stosowania przybliżenia stanu stacjonarnego wprowadzamy: [E]0 = [E] + [ES] Robienie tego potem może skutkować brakiem możliwości usunięcia [ES].

14 STAŁA MICHAELISA Jak łatwo zauważyć z wyprowadzonego równania: Stała Michaelisa to takie stężenie substratu przy którym szybkość jest równa połowie szybkości maksymalnej.

15 STAŁA MICHAELISA Km świadczy o powinowactwie enzymu do substratu. Im mniejsze tym łatwiej osiągnąć vmax zatem powinowactwo większe, zatem substrat lepiej pasuje do dziury w enzymie.

16 „Ty to masz takie Km że w każdą dziurę wejdziesz!”
ŻART BIOCHEMIKÓW „Ty to masz takie Km że w każdą dziurę wejdziesz!”

17 INITIAL RATES METHOD

18 METODA SZYBKOŚCI POCZ. Korzystając z metody szybkości początkowych wyznacz rząd reakcji względem substratów oraz stałą szybkości.

19 OGÓLNA METODA… 𝑣=𝑘 [𝐴] 𝑎 [𝐵] 𝑏 log 𝑣 =𝑙𝑜𝑔𝑘+a ∗log A +b ∗log [B] Utrzymując stałe stężenie [B] podczas eksperymentu: log 𝑣 =𝑎 ∗ log 𝐴 +𝑐𝑜𝑛𝑠𝑡 Co jest funkcją liniową (log(v) = f(log[A])) Współczynnik kierunkowy = a Taką metodę stosuje się przy dużych ilościach danych.

20 CHCĄC ZROZUMIEĆ DUŻE ILOŚCI DANYCH… PRZYKŁAD Z ICHO
40th International Chemistry Olympiad

21 Chcąc obliczyć rząd dla [Br2]

22 Wykres

23 ZADANIE… Otrzymaliśmy w ten sposób rząd zero dla Br2. Zadanie: Wyznacz graficznie rząd dla Na2S2O6 oraz jonów wodorowych.

24 POZORNE STAŁE SZYBKOŚCI