Interdyscyplinarne Koło Naukowe BioMetr

Prezentacja na temat: "Interdyscyplinarne Koło Naukowe BioMetr"— Zapis prezentacji:

1 Interdyscyplinarne Koło Naukowe BioMetr
Wydział Elektrotechniki, Automatyki, Informatyki i Inżynierii Biomedycznej Kraków,

2 Kim są członkowie? Działalność koła 22 osoby
Zaangażowanie 14 pracowników KMiE do merytorycznej pomocy w pracach koła Opiekun Koła: dr inż. Andrzej Skalski Kim są członkowie? Skład Zarządu Koła: Katarzyna Bugajska - przewodnicząca Bartosz Mastalski - v-ce przewodniczący Bartosz Machura - v-ce przewodniczący Filip Schramm - sekretarz Mariola Szklarz - skarbnik INŻYNIERIA BIOMEDYCZNA AUTOMATYKA I ROBOTYKA 22 osoby INFORMATYKA ELEKTROTECHNIKA ELEKTRONIKA I TELEKOMUNIKACJA

3 Obszary zainteresowań
BIOINFORMATYKA INŻYNIERIA BIOMEDYCZNA PROGRAMOWANIE MIKROKONTROLERÓW METROLOGIA ELEKTRONIKA PRZETWARZANIE OBRAZÓW I SYGNAŁÓW MECHANIKA TECHNIKI WIZYJNE ALGORYTMIKA INTELIGENTNE BUDYNKI INTERFEJSY MULTIMODALNE

4 Ośrodki współpracujące
Nawigacja medyczna Aesculap, Tuttlingen Niemcy Wspomaganie diagnostyki i terapii medycznej Świętokrzyskie Centrum Onkologii w Kielcach, Centrum Onkologii Instytut im. Marii Skłodowkiej Curie w Warszawie Bioinformatyka Collegium Medicum Uniwersytetu Jagiellońskiego, Kraków Pomiary parametrów dróg oddechowych Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Rabce

5 Nawigacja medyczna Grant rektorski Opracowanie prototypu lokalizatora 3D dla potrzeb nawigacji medycznej zakup sprzętu: kontrolery wii, kinect, filtry do kamer Szkolenia z nawigacji medycznej dla studentów (prof. J. Kozak, Aesculap, Tuttlingen, Niemcy) Prace inżynierskie i magisterskie realizowane przez 6 dyplomantów Wystąpienie na 50 Konferencji Studenckich Kół Naukowych: System nawigacji medycznej zbudowany w oparciu o popularne kontrolery wii remote OrthoPilot® umożliwiający komputerowe wspomaganie operacji implantacji protezy stawu biodrowego z wykorzystaniem wskaźników laserowych

6 Przetwarzanie, analiza i wizualizacja obrazów
Implementacja algorytmów w Matlabie, oraz OpenCV z wykorzystaniem ITK i VTK. Segmentacja, Dopasowywanie obrazów różnych modalności, Wiualizacja trójwymiarowa, Tworzenie modeli struktur anatomicznych, Wspomaganie diagnostyki i terapii.

7 Wystąpienia na konferencjach
1.Jakub Łągwa, 50. Konferencja Studenckich Kół Naukowych Pionu Hutniczego AGH – Sekcja Akustyki, Biomechaniki i Bioinżynierii, Analiza kształtu struktur anatomicznych okolicy miednicy dla potrzeb radioterapii nowotworu prostaty 2.Jakub Łągwa, XII Sympozjum "Modelowanie i Pomiary w Medycynie", Analiza kształtu struktur anatomicznych jamy brzusznej dla potrzeb radioterapii nowotworu prostaty 3. Bartosz Machura, XVIII Seminarium Studenckiego Ruchu Naukowego AGH – „Kasina Dolna-Bartkowa 2013”, Opracowanie prototypu lokalizatora dla potrzeb nawigacji medycznej 3D 4. Bartosz Mastalski, 50. Konferencja Studenckich Kół Naukowych Pionu Hutniczego AGH – Sekcja Akustyki, Biomechaniki i Bioinżynierii, Segmentacja strun głosowych w endoskopowych zapisach wideo 5. Bartosz Mastalski, Sesja Laureatów 50. Konferencji Studenckich Kół Naukowych Pionu Hutniczego AGH, Segmentacja strun głosowych w endoskopowych zapisach wideo 6. Kamil Kozłowski, Filip Schramm, Mariola Szklarz, Joanna Zygmunt, 50. Konferencja Studenckich Kół Naukowych Pionu Hutniczego AGH – Sekcja Akustyki, Biomechaniki i Bioinżynierii, System nawigacji medycznej zbudowany w oparciu o popularne kontrolery Wii Remote

8 Publikacje 1. Andrzej Skalski, Jakub Łągwa, Piotr Kędzierawski, Paweł Kukołowicz, Analiza kształtu struktur anatomicznych jamy brzusznej dla potrzeb radioterapii nowotworu prostaty, Pomiary, Automatyka, Kontrola, Wydawnictwo PAK, vol. 59, no. 4, pp , ISSN , Gliwice 2013. 2. Andrzej Skalski, Jakub Łągwa, Piotr Kędzierawski, Paweł Kukołowicz, Analiza kształtu struktur anatomicznych jamy brzusznej dla potrzeb radioterapii nowotworu prostaty, materiały XII Sympozjum „Modelowanie i Pomiary w Medycynie”, Wydawnictwo Katedry Metrologii i Elektroniki AGH, pp , ISBN , Kraków 2013. 3. Andrzej Skalski, Jakub Łągwa, Tomasz Zieliński, Piotr Kędzierawski, Tomasz Kuszewski, Automatic Prostate Segmentation in MR images Based on 3D Active Contours with Shape Constraints, artykuł w materiałach konferencyjnych 17th IEEE SPA Conference (Poznań, ), w bazie IEEE oraz w Web of Science 4. Bartosz Mastalski, Segmentacja strun głosowych w endoskopowych zapisach wideo, Publikacje Laureatów L Sesji Studenckich Kół Naukowych PH AGH. Kraków 2013.

9 Nagrody i wyróżnienia –Bartosz Mastalski
Wykonawca grantów rektorskich: Opracowanie prototypu lokalizatora 3D dla potrzeb nawigacji medycznej, 2013 Projekt aktywnych i pasywnych czujników położenia oraz ich analiza metrologiczna w kontekście zastosowania w nawigacji medycznej, 2014 Projekty: Segmentacja strun głosowych w endoskopowych zapisach wideo ( ) Projekt lokalizatora 3D opartego na kontrolerach Wii Remote Plus (2014) Projekt lokalizatora 3D opartego na kamerach przemysłowych oraz jego walidacja względem rozwiązań komercyjnych (2014) I miejsce w konkursie referatów 50. Konferencji Studenckich Kół Naukowych Pionu Hutniczego AGH

10 Nagrody i wyróżnienia – Jakub Łągwa
Informacja o kształcie narządów jako metoda poprawy skuteczności algorytmów segmentacji Skuteczniejsza i bardziej precyzyjna radioterapia nowotworów - wsparcie pracy lekarza przez automat/komputer Opracowanie algorytmów automatycznego wyodrębniania (segmentacji) rozważanych narządów w trójwymiarowych danych obrazowych. Podstawowy wymóg – konieczność precyzyjnego oznaczenia: Obszaru zajętego chorobą nowotworową (GTV) Narządów krytycznych: Odbytnicy, Pęcherza moczowego, Głów kości udowych. wyróżnienie w konkursie referatów 50. Konferencji Studenckich Kół Naukowych Pionu Hutniczego AGH

11 Nawigacja medyczna – Bartosz Machura
Wykonawca grantów rektorskich: Opracowanie prototypu lokalizatora 3D dla potrzeb nawigacji medycznej, 2013 Projekt aktywnych i pasywnych czujników położenia oraz ich analiza metrologiczna w kontekście zastosowania w nawigacji medycznej, 2014 Projekt aplikacji pozwalającej na zapis danych obrazowych z czujnika ruchu Kinect oraz rejestrację i dopasowanie map głębokości. Projekt układu mechanicznego, do którego z jednej strony przymocowano zaprojektowane aktywne czujniki położenia, a z drugiej umieszczono platformę umożliwiającą montaż czujników pasywnych. System aktywny bazuje na emisji promieniowania przez diody IR i stanowi precyzyjny układ referencyjny wykorzystywany do oceny skuteczności innych modeli czujników położenia.

12 Katarzyna Bugajska Zrealizowany projekt:
Segmentacja sekwencji obrazów medycznych (CT, MRI) metodą zbiorów poziomicowych Projekt w trakcie realizacji: Analiza trójwymiarowych obrazów tomografii komputerowej w celu minimalizacji inwazyjności planowanych zabiegów onkologicznych Implementacja algorytmów z zakresu segmentacji, klasyfikacji i rekonstrukcji obrazów, Identyfikacja kluczowych naczyń zasilających zmianę nowotworową umożliwiająca przeprowadzenie zabiegu organooszczędnego, Aplikacja wspomagająca pracę lekarza w zakresie planowania przedoperacyjnego, Stworzenie populacyjnego zbioru trójwymiarowych rekonstrukcji naczyń krwionośnych.

13 Daniel Materowski System przeznaczony do automatycznego pobierania, przetwarzania i analizy wiadomości w języku polskim udostępnianych przez użytkowników sieci społecznościowej Twitter Oprogramowanie zostało utworzone w ekosystemie Python 2.7, oraz uruchomione na platformie Raspberry Pi. System umożliwia: Analizę bieżącego ruchu: Całość ruchu w języku polskim, Śledzenie konkretnych haseł w ruchu polsko-języcznym, Dowolnie utworzony filtr zgodny z Twitter API. Przechowywanie w bazie danych wyników analizy, Wizualizacje zebranych danych poprzez aplikację web-ową.

14 Zainteresowanych zapraszamy do współpracy