Baza danych KSIB w Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie Krajowym Centrum Roślinnych Zasobów Genowych Marcin Zaczyński.

Prezentacja na temat: "Baza danych KSIB w Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie Krajowym Centrum Roślinnych Zasobów Genowych Marcin Zaczyński."— Zapis prezentacji:

1 Baza danych KSIB w Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie Krajowym Centrum Roślinnych Zasobów Genowych Marcin Zaczyński

2 Standard udostępniania danych Darwin Core 1. Data ostatniej modyfikacji9. Gatunek 2. Pełna nazwa taksonomiczna10. Podgatunek 3. Królestwo11. Odmiana 4. Gromada12. Instytucja udostępniająca dane 5. Klasa13. Kraj przechowywania 6. Rząd14. Numer akcesyjny 7. Rodzina15. Rodzaj obiektu 8. Rodzaj16. Kraj pochodzenia obiektu

3 Standard udostępniania danych Access to Biological Collections Data (ABCD 2.06) 1. Kraj przechowywania11. Typ niższego oznaczenia taksonomicznego 2. Kod instytucji przechowującej (FAO Institute Code) 12. Niższe oznaczenie taksonomiczne 3. Numer akcesyjny13. Pełna nazwa taksonomiczna 4. Data ostatniej modyfikacji14. Rodzina 5. Rodzaj obiektu15. Nazwa najwyższej kategorii taksonomicznej 6. Numer kolekcyjny/ekspedycyjny16. Nazwa zwyczajowa 7. Kod instytucji zbierającej (FAO Institute Code) 17/18. Nazwa obiektu 8. Rodzaj19. Data pozyskania obiektu 9. Gatunek20. Kraj pochodzenia obiektu 10. Autor oznaczenia taksonomicznego21. Język opisu miejsca zbioru

4 Standard udostępniania danych Access to Biological Collections Data (ABCD 2.06) 22. Miejsce zbioru31. Pochodzenie/opis rodowy 23. Szerokość geograficzna32. Siedlisko 24. Długość geograficzna33. Kod donora (FAO Institute Code) 25. Dokładność współrzędnych geograficznych 34. Inne numery identyfikacyjne 26. Wysokość npm35. Miejsce przechowywania duplikatów bezpieczeństwa (FAO Institute Code) 27. Data zbioru próbki (format ISO)36. Dodatkowe informacje 28. Data zbioru próbki (niepełna data)37. Instytucja zbierająca (brak kodu FAO) 29. Kod hodowcy (FAO Institute Code)38. Instytucja dawcy (brak kodu FAO) 30. Rodzaj obiektu39. Hodowca (brak kodu FAO)

5 Dane udostępniane Tabela Zbóż i Traw Tabela Ekspedycji Tabela Herbarium Tabela danych paszportowych dostępnych obiektów KCRZG -59829 obiektów Tabela danych paszportowych obiektów KCRZG niedostępnych (obiekty utracone z kolekcji w wyniku zdarzeń losowych) - 8373 obiekty Tabela obiektów Herbarium przechowywanych w fiolkach (martwe nasiona roślin) - 10205 obiektów Łącznie udostępnianych jest 78407 rekordów dla sieci GBIF (wzrost o 17390 rekordów)

6 Obiekty niedostępne Mają przypisany unikalny numer banku genów (numer akcesyjny) Obiekty posiadają nazwy, oraz opis hodowlany (linia hodowlana, odmiana uprawna) Obiekty posiadają informację o dawcy, hodowcy, materiale użytym do wyhodowania odmiany

7 Poprawa jakości danych Dodano nazwy zwyczajowe (common names) Poprawiono i uzupełniono opis taksonomiczny Opis miejsca zbioru został wzbogacony o podział administracyjny kraju –Woj: mazowieckie, Pow: ciechanowski, Gm: Ciechanów, wieś Patory 13, Uzupełniono geokoordynaty dla obiektów z podanym miejscem zbioru

8 Geokoordynaty Nazwa zbioru % obiektów posiadających geokoordynaty Tabela danych paszportowych obiektów KCRZG niedostępnych 1,2 Tabela danych paszportowych dostępnych obiektów KCRZG 28 -Odmiany hodowlane trafiają do banku genów od kuratorów, a do kuratorów od hodowców -Co roku w tym samym miejscu rozmnażane są różne obiekty -Geokordynaty zapisywane są dla: -Odmian miejscowych (uprawiane od wielu lat w tym samym miejscu) -Kolekcji roślin chronionych -Kolekcji roślin sadowniczych

9 Oprogramowanie do obsługi dokumentacji KCRZG System dostępny za pośrednictwem przeglądarki internetowej Kuratorzy mają pełny dostęp do danych paszportowych które sami wprowadzili Każdy użytkownik systemu ma swój login i hasło

10 Nowy system bazodanowy Kuratorzy kolekcji są odpowiedzialni za poprawność danych Mechanizm tworzenia raportów (w tym danych dla użytku KSIB) Ograniczone prawa dostępu do systemu zapobiegające powstawaniu błędów

11 EGISET – System bazodanowy dla celów KCRZG

12

13 EGISET – System bazodanowy celów KCRZG

14 EGISET – System bazodanowy dla celów KCRZG

15 Podsumowanie 2004-2008 RokLiczba udostępnianych rekordów 2004 40458 2005 43379 2006 49066 2007 55019 2008 78407

16 Podsumowanie 2004-2008

17 Dziękuje