Organizacja i ekspresja genomu eukariotycznego

Prezentacja na temat: "Organizacja i ekspresja genomu eukariotycznego"— Zapis prezentacji:

1 Organizacja i ekspresja genomu eukariotycznego
Katarzyna Kozioł Magdalena Machowska Katarzyna Piekarowicz (Pracownia Białek Jądrowych, p.41c,

2 Cel ćwiczeń: Analiza procesu dekondensacji chromatyny
Analiza procesu wiązania białek do chromatyny podczas dekondensacji Przygotowanie preparatów umożliwiających analizę morfologii jąder komórkowych w różnych stadiach rozwojowych muszki owocowej embrion larwa poczwarka jajniki Analiza morfologii jąder komórkowych w różnych fazach cyklu komórkowego w komórkach w hodowlach komórkowych

3 METODA IN VITRO NUCLEAR ASSEMBLY
- ANALIZA DEKONDENSACJI CHROMATYNY ORGANIZACJA CHROMATYNY REPLIKACJA BADANIE MITOZY WPŁYW WYBRANYCH BIAŁEK NA PROCESY DEKONDENSACJI I ODTWARZANIA OTOCZKI -chromatyna -ekstrakt - energia ODTWARZANIE JĄDER KOM.: - ekstrakt z oocytów Xenopus laevis (żaba szponiasta) - LSS - DSP odbłoniona chromatyna ze spermy Xenopus (demembranated sperm chromatin) - inhibitor coctail - energy mix: ATP, PC (fosforan kreatyniny), PCKinase

4 Analiza procesu dekondensacji chromatyny

5 Odtwarzanie jąder komórkowych (chromatyna i otoczka)

6 Populacje pęcherzyków mitotycznych NEP-B i NEP-A
Widoczne pęcherzyki błonowe asocjujące z chromatyną Widoczne prekursory porów i kompletne kompleksy porowe.

7 Budowa otoczki jądrowej

8 -wpływają na replikację, transkrypcję, splicing
LAMINY -wraz z innymi białkami otoczki jądrowej tworzą dynamiczny szkielet białkowy zapewniający mechaniczną podporę otoczki jądrowej -kontrolują umiejscowienie kompleksów porowych w obrębie otoczki jądrowej -regulują organizację przestrzenną chromatyny, stanowią miejsce kotwiczenia domen chromatynowych -wpływają na replikację, transkrypcję, splicing -zaangażowane są w procesy starzenia, różnicowania i apoptozy Molecular Biology of the Cell Alberts,B i wsp., (1994) TYPY LAMIN (ludzkie) -B: (LMNB1) - B1 (LMNB2) –B2, B3 -A/C (LMNA) , A, C,C2, A10

9 Wpływ emeryny na odtwarzanie struktury otoczki jądrowej in vitro

10 Przygotowanie preparatów umożliwiających analizę morfologii jąder komórkowych w różnych stadiach rozwojowych muszki owocowej

11 Dymorfizm płciowy u Drosophila melanogaster

12 Budowa jajników u Drosophila melanogaster
Jajniki Cewka jajnikowa (owariola)

13 Owariole i komory jajowe muszki owocowej

14 Analiza dystrybucji obu typów lamin w embrionach D
Analiza dystrybucji obu typów lamin w embrionach D.melanogaster przy użyciu mikroskopii konfokalnej.

15 Analiza morfologii jąder komórkowych w różnych fazach cyklu komórkowego

16 Formowanie wrzeciona podziałowego
The Cell A Molecular Approach Geoffrey M. Cooper Boston University Second Edition Sinauer Associates, Inc., ISBN

17

18

19

20 Do zobaczenia na ćwiczeniach.
Dziękujemy za uwagę! Do zobaczenia na ćwiczeniach. Zaliczenie: - kolokwium ( termin do uzgodnienia) praca na ćwiczeniach obecność