Genetyczne czynniki chorobotwórcze

Prezentacja na temat: "Genetyczne czynniki chorobotwórcze"— Zapis prezentacji:

1 Genetyczne czynniki chorobotwórcze
Etiologia i patogeneza wybranych zaburzeń genetycznych u zwierząt

2 Genetyczne czynniki chorobotwórcze
Kariotypy zwierząt domowych. Metody badania i zasady opisu kariotypów. Kariotypy wzorcowe i identyfikacja chromosomów przy użyciu prążków G i C. Typy mutacji punktowych i chromosomalnych: strukturalnych i liczbowych. Zaburzenia genetyczne u zwierząt domowych spowodowane przez mutacje chromosomalne strukturalne: translokacja robertsonowska u bydła, odwrócenie płci u koni, odwrócenie płci u psów. Mutacje chromosomalne strukturalne jako przyczyny nowotworów – chromosom Philadelphia (Ph1) u ludzi i psów. Zaburzenia genetyczne u zwierząt domowych spowodowane przez mutacje chromosomalne liczbowe (monosomia chromosomu X u klaczy, trisomie chromosomów somatycznych u koni i bydła, występowanie nadliczbowych chromosomów X lub Y u koni). Metody identyfikacji mutacji genowych: PCR – łańcuchowa reakcja polimerazy RFLP – polimorfizm długości fragmentów restrykcyjnych. Choroby genetyczne uwarunkowane mutacjami genowymi – etiologia i patogeneza (BLAD – niedobór leukocytarnych cząsteczek adhezyjnych u bydła, DUMPS – niedobór syntazy monofosforanu urydyny u bydła, PSS – syndrom stresowy u świń) Wykorzystanie metod PCR i RFLP w diagnostyce BLAD, DUMPS i PSS. Reakcja PCR i RFLP – animacje komputerowe. Ćwiczenie praktyczne: izolacja chromosomów i analiza kariotypu w oocytach prawidłowych oraz oocytach z zaburzeniami o charakterze euploidii i aneuploidii pochodzących od świń.

3 Nazwa zwyczajowa Nazwa gatunkowa 2n
Diploidalna liczba chromosomów niektórych gatunków zwierząt (wg Datta’y 1979, Kluga i cummingsa 1983, Larousse’a 1990 oraz Świtońskiego 1982, 1987, 1988) Nazwa zwyczajowa Nazwa gatunkowa 2n Człowiek Szympans Goryl Rezus Bydło domowe Bydło zebu Bawół azjatycki Koza Owca Świnia domowa Dzik Koń domowy Koń Przewalskiego Osioł Onager (półosioł) Wielbłąd jednogarbny Pies Szakal Lis pospolity Homo sapiens Pan troglodytes Gorilla gorilla Macaca mullata Bos taurus Bos indicus Bubalus bubalis Capra hirus Ovis aries Sus domestica Sus scrofa Equus caballus Equus caballus przewalski Equus asinus Equus hemionus onager Camelus dromedarius Canis familiaris Canis aureus Vulpes vulpes 46 48 42 60 54 38 36 64 66 62 56 70 78 34 W niektórych narządach, np. wątrobie, występują komórki o zwielokrotnionej liczbie chromosomów, zwane poliploidalnymi

4 W zależności od umiejscowienia centromeru chromosomy dzielimy na:
Metacentryczne – centromer pośrodku długości chromosomu Akrocentryczne – centromer blisko końca chromosomu Submetacentryczne – pozycja pośrednia centromeru w odniesieniu do chromosomów meta- i akrocentrycznych Telocentryczne – centromer na końcu chromosomu W chromosomie metacentrycznym ramiona p (krótkie) i q (długie) są równej długości

5

6 Typy mutacji chromosomowych strukturalnych
Deficjencja a) terminalna b) interstycjalna Translokacje a) fuzje centryczne b) insercje Duplikacja Inwersja a) paracentryczna b) pericentryczna 5. Izochromosomy 6. Chromosomy pierścieniowe 7. Chromosomy dicentryczne

7

8 Trisomie chromosomów bydła
Kariotyp Rasa Płeć Fenotyp 60,XX + 22 Simental F Normalny 60,XX t(12;12)+12 Defekt budowy, martwe urodzenia 60,XX t(20;20)+20 61,XX + 19 61, XY + 20 Romanga la M Deformacja kończyn, ślepota , brak zewnętrznych narządów płciowych 61, XY + 27 Hereford Ogólny niedorozwój narządów wewnętrznych, hipoplazja płuc 60,XX/60, XY/61, XXY Hipoplazja jąder, degeneracja nasieniowodów 61, XXY Hipoplazja jąder, oligospermia 60,XY/61, XXY Niska jakość nasienia 61,XXY Żeńskie cechy budowy, hipoplazja jąder, azoospermia 61,XXX Charolaise

9 Translokacja robertsonowska – fuzja centryczna pojawiająca się najczęściej u bydła. Polega na połączeniu się centromerami dwóch akrocentrycznych autosomów i wytworzeniu formy meta- lub submetacentrycznej. Wystąpienie takich struktur w komórkach prowadzi do zmniejszenia ogólnej liczby chromosomów z utrzymywaniem się dotychczasowej liczby ramion chromatyd i nie zmienionej ilości DNA. Najczęściej spotykana jest fuzja największego (1) i najmniejszego (29) autosomu, znana jako translokacja 1:29. Ta forma aberracji występuje u ponad 60 ras bydła domowego, m.in. u szwedzkiego czerwono-białego, rasy południowosyberyjskiej i u rasy polskiej czerwonej. Nosiciele translokacji – zarówno buhaje, jak i krowy odznaczają się prawidłową budową i parametrami fizjologicznymi. Negatywnym efektem tej aberracji jest obniżenie płodności nosicieli powodowane wzrostem wczesnej śmiertelności zarodkowej. Translokacje robertsonowskie stwierdza się także u owiec, kóz, świń i lisów polarnych (u tych ostatnich obserwuje się korzystne efekty mutacji).

10 Translokacja albo fuzja robertsonowska chromosomu 1/29 u krowy

11 PCR – Polymerase Chain Reaction
(łańcuchowa reakcja syntezy fragmentów DNA RFLP- Restriction Fragment Lenght Polymorphism (polimorfizm długości fragmentów restrykcyjnych) BLAD- Bovine Leukocyte Adhesion Deficiency (wrodzony niedobór leukocytarnych cząsteczek adhezyjnych u bydła) LAD- Leukocyte Adhesion Deficiency (wrodzony niedobór leukocytarnych cząsteczek adhezyjnych) DUMPS-Deficiency of Uridine Monophosphate Synthase (wrodzony deficyt syntazy monofosforanu urydyny) PSS Porcine Stress Syndrome (zespół stresowy świń)

12 Zastosowanie techniki PCR
Identyfikacja kwasów nukleinowych genów, bakterii, wirusów Wykrywanie czynników zakaźnych, zwłaszcza latentnych wirusów Prenatalna diagnostyka genetyczna Wykrywanie polimorfizmu alleli Precyzyjne ustalanie typu tkanek do transplantacji Badania nad ewolucją przy wykorzystaniu próbek kopalnych Diagnostyka chorób genetycznych – etap wstępny

13 Aby zamplifikować poszukiwany fragment DNA potrzebne są:
Materiałem do izolacji kwasu nukleinowego mogą być: hodowla komórkowa, bakterie, krew, wyciągi tkankowe, mleko, sperma, cebulki włosowe Aby zamplifikować poszukiwany fragment DNA potrzebne są: Wyizolowany z materiału biologicznego i oczyszczony DNA (matryca) Mieszanka nukleotydów zawierająca A, C, G, T –składniki potrzebne do zbudowania nowej nici interesującego nas fragmentu DNA 3) Polimeraza DNA 4) Czynniki inicjujące syntezę – startery - syntetyczne oligonukleotydy o sekwencji odpowiadającej ściśle obu końcom powielanego odcinka

14 Postępowanie przy wykrywaniu chorób genetycznych
Izolacja DNA z wybranego materiału biologicznego 2) Amplifikacja metodą PCR analizowanego fragmentu DNA 3) Analiza restrykcyjna zamplifikowanego genu (RFLP) 4) Uwidocznienie fragmentów restrykcyjnych za pomocą elektroforezy (charakterystyczny dla danego genu i mutacji zestaw fragmentów restrykcyjnych o określonej długości pozwalający stwierdzić, czy badany materiał pochodził od osobnika zdrowego, chorego, czy też od nosiciela)

15 Niedobór leukocytarnych cząsteczek adhezyjnych u bydłą (BLAD)

16 2 homozygota mutacji BLAD
383 nukleotyd GEN PRAWIDŁOWY….CATCGACCTGT… MUTACJA BLAD ….. CATCGGCCTGT …. Taq I genotyp normalny 2 homozygota mutacji BLAD 3 nosiciel mutacji BLAD Wykrywanie mutacji punktowej będącej przyczyną BLAD u cieląt metodami PCR/RFLP.

17 Courtesy the Hospital Practice web site ...

18 Wykrywanie mutacji punktowej będącej przyczyną DUMPS u bydła metodami PCR/RFLP.

19 Przykłady enzymów restrykcyjnych wykorzystywanych w technice RFLP oraz rozpoznawanych przez nie sekwencji palindromowych

20 Wykrywanie mutacji punktowej będącej przyczyną PSS u świń u osobników chorych i nosicieli metodami PCR/RFLP.

21 Nondysjunkcja mejotyczna jako przyczyna aberracji liczbowych o charakterze aneuploidii

22 Kariotyp (chromosomy w płytce metafazowej) pochodzące od:
klaczy (64,XX) ogiera (64,XY) klaczy z monosomią chromosomu X (63,X0) klaczy z trisomią chromosomu X (65,XXX)

23

24 Ćwiczenie praktyczne: izolacja chromosomów i analiza kariotypu w oocytach prawidłowych oraz oocytach z zaburzeniami o charakterze euploidii i aneuploidii pochodzących od świń. Jajniki pobrać podczas uboju i w ciągu godziny przetransportować do laboratorium w płynie fizjologicznym (temp oC). Wyznaczyć na szkiełku podstawowym pole o pow. ok. 1 cm2. Umieścić kroplę podłoża hodowlanego w wyznaczonym polu. Po oczyszczeniu jajnika z okolicznych tkanek, przepłukaniu w płynie fizjologicznym oraz umieszczeniu w jałowej płytce Petriego, wykonać nakłucie pęcherzyków i aspirację płynu zawierającego oocyty. Pobrany płyn przenieść do kropli podłoża umieszczonej na szkiełku podstawowym i pod kontrolą mikroskopu sprawdzić miejsce położenia oocytów. Oocyty poddać działaniu I-go roztworu utrwalającego (metanol/kwas octowy – 1:1) – nanosząc pod kontrolą mikroskopu 1-2 krople – pozostawić na 5 min. Następnie nanieść na preparat oocytów 1-2 krople II-go roztworu utrwalającego (metanol/kwas octowy – 3:1) – pozostawić na 60 min., uzupełniając roztwór w przypadku wysychania. Usunąć nadmiar II-go roztworu utrwalającego i zabarwić preparaty 5% roztworem barwnika Giemzy (5-10 min). Dokonać pod mikroskopem analizy pod kątem oceny stadium dojrzewania i występowania ewentualnych aberracji.

25 Chromosomy wyizolowane z oocytów świń -
obraz spod mikroskopu odwróconego pola Oocyt - klasa I Oocyt - klasa III Oocyt - klasa IV

26 Analiza chromosomów (Giemsa, FISH) w ooocytach świń dojrzewającyhch in vitro . Giemsa: (A)oocyt haploidalny(n = 19); (Boocyt diploidalny (2n = 38). FISH: ©oocyt haploidalny; (D) aneuploidia disomia chromosomu 1; (E) aneuploidia disomia chromosomu 10; (F)oocyt diploidalny.