PROTEIN MODEL PLATFORM WEBMOBIS Krzysztof Gapiński Marcin Różański Paweł Ślusarczyk Magdalena Ziębińska Promotor: dr inż. Piotr Łukasiak
Plan prezentacji 1. Wstęp. 2. Założenia projektu. 3. Użyte technologie. 4. Zaimplementowane moduły platformy Webmobis. 5. Podsumowanie.
Wstęp Czym jest bioinformatyka? Czym jest bioinformatyka? Zastosowania: Zastosowania: porównanie podobieństw miedzy sekwencjami genów analiza struktur DNA i RNA białek wyszukiwanie homologi genów
Wstęp Software Development Studio Software Development Studio Klient – Uniwersytet Kalifornijski Klient – Uniwersytet Kalifornijski Problemy klienta: Problemy klienta: rozproszenie danych chaos informacyjny brak narzędzi wspomagających
Założenia projektu. rozwój metaserwera integracja istniejących narzędzi implementacja nowych funkcji ujednolicenie formatów danych
Moduły platformy Serwery predykcji struktur białek Serwery predykcji struktur białek Przeszukiwanie istniejących baz danych Przeszukiwanie istniejących baz danych Narzędzia do wizualizacji Narzędzia do wizualizacji
Technologie JAVA JAVA Tapestry Tapestry Ant Ant Eclipse Eclipse Tomcat Tomcat PostgreSQL PostgreSQL Java Web Start Java Web Start
Serwery predykcji struktur białek
Przeszukiwanie baz danych ModBase (
Przeszukiwanie baz danych
SwissModel (
Narzędzia do wizualizacji Pymol
Narzędzia do wizualizacji Spice
Podsumowanie Efekt końcowy Efekt końcowy Praktyczne wykorzystania Praktyczne wykorzystania
Koniec Dziękujemy za uwagę. Dziękujemy za uwagę.