Pobieranie prezentacji. Proszę czekać

Pobieranie prezentacji. Proszę czekać

PROTEIN MODEL PLATFORM WEBMOBIS Krzysztof Gapiński Marcin Różański Paweł Ślusarczyk Magdalena Ziębińska Promotor: dr inż. Piotr Łukasiak.

Podobne prezentacje


Prezentacja na temat: "PROTEIN MODEL PLATFORM WEBMOBIS Krzysztof Gapiński Marcin Różański Paweł Ślusarczyk Magdalena Ziębińska Promotor: dr inż. Piotr Łukasiak."— Zapis prezentacji:

1 PROTEIN MODEL PLATFORM WEBMOBIS Krzysztof Gapiński Marcin Różański Paweł Ślusarczyk Magdalena Ziębińska Promotor: dr inż. Piotr Łukasiak

2 Plan prezentacji 1. Wstęp. 2. Założenia projektu. 3. Użyte technologie. 4. Zaimplementowane moduły platformy Webmobis. 5. Podsumowanie.

3 Wstęp Czym jest bioinformatyka? Czym jest bioinformatyka? Zastosowania: Zastosowania: porównanie podobieństw miedzy sekwencjami genów analiza struktur DNA i RNA białek wyszukiwanie homologi genów

4 Wstęp Software Development Studio Software Development Studio Klient – Uniwersytet Kalifornijski Klient – Uniwersytet Kalifornijski Problemy klienta: Problemy klienta: rozproszenie danych chaos informacyjny brak narzędzi wspomagających

5 Założenia projektu. rozwój metaserwera integracja istniejących narzędzi implementacja nowych funkcji ujednolicenie formatów danych

6 Moduły platformy Serwery predykcji struktur białek Serwery predykcji struktur białek Przeszukiwanie istniejących baz danych Przeszukiwanie istniejących baz danych Narzędzia do wizualizacji Narzędzia do wizualizacji

7 Technologie JAVA JAVA Tapestry Tapestry Ant Ant Eclipse Eclipse Tomcat Tomcat PostgreSQL PostgreSQL Java Web Start Java Web Start

8 Serwery predykcji struktur białek

9

10 Przeszukiwanie baz danych ModBase (http://modbase.compbio.ucsf.edu)

11 Przeszukiwanie baz danych

12 SwissModel (http://swissmodel.expasy.org)http://swissmodel.expasy.org

13

14 Narzędzia do wizualizacji Pymol

15 Narzędzia do wizualizacji Spice

16 Podsumowanie Efekt końcowy Efekt końcowy Praktyczne wykorzystania Praktyczne wykorzystania

17 Koniec Dziękujemy za uwagę. Dziękujemy za uwagę.


Pobierz ppt "PROTEIN MODEL PLATFORM WEBMOBIS Krzysztof Gapiński Marcin Różański Paweł Ślusarczyk Magdalena Ziębińska Promotor: dr inż. Piotr Łukasiak."

Podobne prezentacje


Reklamy Google