Pobieranie prezentacji. Proszę czekać

Pobieranie prezentacji. Proszę czekać

Organizacja materiału genetycznego u roślin. Chromatyna wypełnia jądro komórkowe.

Podobne prezentacje


Prezentacja na temat: "Organizacja materiału genetycznego u roślin. Chromatyna wypełnia jądro komórkowe."— Zapis prezentacji:

1 Organizacja materiału genetycznego u roślin

2 Chromatyna wypełnia jądro komórkowe

3 Maksymalny stopień kondensacji DNA osiąga w chromosomach

4 Białka histonowe

5 S znur korali (beads on the string) Olins & Olins, 1973

6 Photo of chromatin digested by nuclease, from Hewish and Burgoyne's 1973 experiment. Dean Hewish, 1973 Leigh Burgoyne, 1973

7 Trawienie chromatyny DNAzą -Drabinka nukleosomowa

8 Roger Kornberg w 1974 r. zaproponował model, w którym DNA owinięty jest wokół rdzenia histonowego tworząc nukleosom NUKLEOSOM JEST PODSTAWOWĄ JEDNOSTKĄ STRUKTURALNĄ CHROMATYNY

9 Fałd histonowy

10 Złożenie fałdów (hand shake)

11 Konserwowane elementy na obrzeżu oktameru

12 Oktamer – oddziaływanie z DNA

13 Luger K, Mader AW, Richmond RK, Sargent DF, Richmond TJ. Nature 1997 Sep18;389(6648): Karolin Luger Timothy Richmond Struktura krystalogtaficzna cząstki rdzeniowej nukleosomu

14 Składanie nukleosomu

15 Zaginanie i zwijanie DNA na oktamerze Ściśle zwinięta lewoskrętna superhelisa ma ok. 80 pz na zwój i skok superhelikalny ok. 27,5 A.

16 Ekspozycja miejsc w helisie DNA na oktamerze

17 Mutacje SIN znoszą oddziaływania oktameru z DNA

18 Cząstka rdzeniowa, chromatosom i nukleosom

19 Umiejscowienie H1 w nukleosomie

20 Rodzaje chromatyny w jadrze

21 Regulacyjna rola chromatyny

22 Struktury ponadnukleosomowe

23 Nukleosomy zajmują określone miejsca w chromatynie A. Schemat ułożenia nukleosomów w chromatynie, pojęcie długości powtórzeń nuklesomowych. B. Silnie zlokalizowane i rozmyte nukleosomy. C. Nukleosomy a miejsca wiązania czynników transkrypcyjnych. G. Arya et al. jbsd 2010

24 Nukleosomy a transkrypcja Schemat otwartych (A) i zamkniętych (B) promotorów. Typowa mapa pozycyjna nukleosomów na otwartym promotorze pokazuje wyraźne wyróżnienie locus genowego przez obecność rejonów 5 i 3 wolnych od nukleosomów (NDR). (TSS) - miejsce startu transkrypcji. 5 NDR sąsiaduje z silnie związanymi nukleosomami. G. Arya et al. jbsd 2010

25 Pozycjonowanie nukleosomów

26 Struktura a funkcja chromatyny

27 Zmiany struktury chromatyny modyfikacje DNA modyfikacje potranslacyjne histonów wyspecjalizowane warianty histonów ATP-zależna przebudowa (remodeling) chromatyny

28 Metylacja DNA, Metylomy

29

30 Metylacja cytozyny w DNA

31

32 U bliźniąt monozygotycfznych różnice epigenetyczne (metylacja DNA) nagromadzają się w życiu osobniczym Significant DNA methylation changes are indicated as thick red and green blocks in the ideograms. The 50-year-old twin pair shows abundant changes in the pattern of DNA methylation (green=hypermethylation and red=hypomethylation), 3-year-old twins have a very similar DNA methylation (yellow). "...We found that, although twins are epigenetically indistinguishable during the early years of life, older monozygous twins exhibited remarkable differences in their overall content and genomic distribution of 5-methylcytosine DNA and histone acetylation, affecting their gene-expression portrait. These findings indicate how an appreciation of epigenetics is missing from our understanding of how different phenotypes can be originated from the same genotype." Proc Natl Acad Sci U S A Jul 26;102(30): Copyright (2005) National Academy of Sciences, U.S.A

33 Turner 2002 Modyfikacje potranslacyjne białek histonowych

34 Modyfikacje potranslacyjne białek histonowych – kod histonowy

35 Modyfikacje potranslacyjne białek histonowych Kozaurides 2007

36 Acetylacja lizyny w histonach

37 Elektroforetyczny dowód acetylacji histonów

38 Efekt acetylacji ogonów histonowych

39 Mechanizm działania modyfikacji potranslacyjnych białek histonowych Działanie pośrednie: rekrutacja białek rozpoznających określone modyfikacje Kozaurides 2007 Działanie bezpośrednie: zmiany w oddziaływaniach histon-DNA i histon-histon

40 Warianty histonów – H2A

41 Warianty histonów - rozmieszczenie w chromosomach

42 Swp 73 Swi3 Snf5 Snf2 ISWI SWI/SNFISWI Mi2 ATP-zależna przebudowa (remodeling) chromatyny Główne typy kompleksów remodelujących chromatynę

43 Kingston & Narlikar, 1999 Działanie kompleksów remodelujących chromatynę DDM1 ATP Brzeski & Jerzmanowski, 2003

44 Jeden z mechanizmów remodelingu: przesunięcie oktameru histonów wzdłuż nici DNA ATP-zależna przebudowa (remodeling) chromatyny

45 Chromatyna – hierarchia struktur


Pobierz ppt "Organizacja materiału genetycznego u roślin. Chromatyna wypełnia jądro komórkowe."

Podobne prezentacje


Reklamy Google